阻隔水流法主要適用於海水入侵通道比較狹窄的地區。阻隔水流是在海岸線附近布置一排抽水井進行抽水,在地下含水層中形成一個抽水槽隔離帶(水頭降落帶),從而阻止威水向正在開採的淡水含水層入侵。
與此相反,利用淨化後的廢污水進行回灌,在含水層的鹹、淡水分界面上形成高於外圍地區地下水位的“補給水丘”藉助“水丘”的壓力阻止海水向內陸運移,也可減緩或阻止海水入侵。建立地下水動態監測網進行水位、水化學監測,必要時輔以海水水文動態監測。根據海水人侵的形成機制和入侵規律,預測海水入侵速率、規模和危害範圍,從而為有效防治海水入侵提供科學依據。