阻隔分離是指根據害蟲活動習性人為設定障礙，阻止其擴散蔓延和為害。如果實套袋防止果樹食心蟲產卵和幼蟲蛀害；樹幹塗膠，刷塗白劑，可防止一些害蟲產卵和為害；在瓜秧的根莖周圍鋪沙或廢紙，防止黃守瓜產卵；在糧食表面覆蓋草木灰，糠殼或惰性粉，可阻止貯糧害蟲的侵入；利用蟲體與穀粒體積和比重不同，採用過篩或風扇等措施使糧、蟲分離等。
