關節型、膿皰型和尋常型銀屑病易感位點差別研究

《關節型、膿皰型和尋常型銀屑病易感位點差別研究》是依託復旦大學，由張崢擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：關節型、膿皰型和尋常型銀屑病易感位點差別研究
• 依託單位：復旦大學
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：張崢

項目摘要

尋常型銀屑病占銀屑病的80%以上，膿皰型、關節炎型、紅皮病型銀屑病儘管不足20%，但臨床表現更加嚴重、治療效果差。近年來通過全基因組關聯分析和外顯子測序發現尋常型銀屑病易感基因達40餘種，促進了對尋常型銀屑病發病機制中遺傳易感性的認識，許多易感基因已經成為銀屑病生物治療的靶點。儘管也發現IL12B和HLA-C與關節炎型銀屑病相關，IL36RN與膿皰型銀屑病相關。但其他亞型銀屑病的遺傳易感性知之甚少，本課題擬用Sequenom和測序平台，研究膿皰型和關節炎型銀屑病是否存在尋常型銀屑病的共同易感基因，關節炎型銀屑病是否存在類風濕性關節炎、強直性脊柱炎的共同易感基因，找出三種亞型銀屑病易感基因的差別。通過基因相互作用研究，基因與表型關係研究，疾病基因生物學通路研究等為關節炎型和膿皰型銀屑病的遺傳易感性提供證據，也為銀屑病亞型生物靶向治療研究提供方向。

結題摘要

本項目旨在通過候選用Sequenom基因分型平台，研究膿皰型和關節炎型銀屑病是否存在尋常型銀屑病的共同易感基因，找出三種亞型銀屑病易感基因的聯繫與差別。為治療研究提供方向。 本研究發現了3個關節型銀屑病顯著位點，7個潛在相關位點，最顯著位點位於在5q33.3， IL12B為此區域候選基因。另一顯著位點為1p36，此區域僅有一個基因為RUNX3，RUNX3與CD8+ T淋巴細胞分化相關。此外位於1q21.3 的SNP rs1886734也被證實與關節型銀屑病相關。使用permutation 檢驗，矯正後P值依然顯著。我們使用非參 MDR 尋找基因間相互作用模式，發現SNPs rs1886734 與 rs7709212是關節型銀屑病相關最佳互作模式。在膿皰型銀屑病候選基因研究中，我們發現2個膿皰型銀屑病相關位點和1個提示位點。最顯著的位點位於5q33.1。此區域包含2個基因：TNIP1 和ANAA6。IPA分析發現此區域有3個有顯著意義pathway可被注釋到TNIP1上。因此我們推斷TNIP1為此區域相關基因。另一個顯著位點為rs3813063，此區域基因為CARD14。此外我們還發現了提示顯著性位點為rs10088247。此區域只有一個基因CSMD1， 為表皮或者上皮的腫瘤抑制基因。最後，我們發現上述基因可被注釋於一個pathway中。這些研究為後續開展各種亞型銀屑病預測，早期診斷，藥物療效和副作用觀察，靶向治療的精準醫學研究提供了重要的參考數據。