《尋常型銀屑病易感基因GJB2功能性SNP的確定和生物效應研究》是依託中南大學，由吳麗莎擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：尋常型銀屑病易感基因GJB2功能性SNP的確定和生物效應研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：吳麗莎
- 依託單位：中南大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
銀屑病是一類具有複雜遺傳背景的皮膚疾病，隨著全基因組關聯分析(GWAS)的發展，銀屑病遺傳研究領域積累了許多有價值數據。本研究擬鎖定中國人群銀屑病GWAS研究已公布易感基因GJB2，首先在中國南部漢族人群重複驗證其多態位點rs3751385與銀屑病的關聯，並開展易感基因單倍型與銀屑病性狀/表型如：疾病嚴重程度的關聯分析。為尋找銀屑病易感基因GJB2的功能性SNP，先篩選能影響GJB2基因編碼蛋白Cx26功能的SNP，並對100例南部漢族正常人基因組DNA進行包括GJB2基因編碼區和調控區的全長測序，明確其SNP分布情況後，利用單倍型構建、生物信息學和關聯分析等方法發現GJB2潛在功能性SNP，再選取功能性SNP，運用基因型載體構建、免疫螢光、染料轉運及細胞生物學等方法，證實GJB2功能性SNP的生物學效應。旨在初步解答銀屑病易感基因GJB2功能性SNP發揮的具體作用和影響疾病表型的機制。
結題摘要
本項目立足於中國人群尋常型銀屑病全基因組關聯研究已公布的GWAS研究數據，鎖定尋常型銀屑病易感基因GJB2。（1）首先通過病例-對照關聯方法，成功驗證尋常型銀屑病易感基因GJB2的SNP位點rs3751385：C＞T與疾病易感存在明顯關聯性；（2）其次，通過在100例中國南部正常人群基因組中擴增GJB2基因編碼區和部分調控區的片段，直接測序，獲知GJB2基因存在的SNP位點與Hapmap資料庫公布的一致，包括多態位點rs2274084：C＞T，rs2274083：A＞G，和rs3751385：C＞T，除位點rs3751385在銀屑病與正常對照的關聯研究中呈現顯著差異，其他多態位點並無顯著差異；（3）免疫組織化學研究亦顯示尋常型銀屑病患者皮損內GJB2基因編碼的CX26蛋白水平較正常對照明顯增高，同時以GJB2基因多態位點rs3751385：C＞T作為分型依據，將銀屑病患者分為：TT，CC和CT三種基因型，發現能增加銀屑病患病風險的TT基因型患者皮損組織GJB2的mRNA和蛋白水平均較其他兩種基因型明顯增加，並且與銀屑病嚴重程度有相關性，及TT基因型患者PASI評分較CC和CT基因型增加，疾病嚴重程度增加。（4）比較尋常型銀屑病患者與正常對照人群血漿GJB2的水平，結果顯示銀屑病患者GJB2濃度明顯低於正常對照組，而血漿GJB2濃度與銀屑病患者PASI積分呈負相關（r=-0.247, p=0.036）；（5）功能研究顯示，銀屑病易感基因GJB2多態位點rs72474224：C＞T，改變其編碼蛋白CX26胺基酸序列，但並不影響細胞增殖及細胞周期功能。通過本研究項目，我們證實GJB2基因與中國南部人群尋常型銀屑病易感性相關；明確了中國南部人群GJB2基因編碼區及部分調控區內SNP分布情況；同時初步發現，易感基因GJB2多態位點rs72474224：C＞T這一能改變編碼蛋白CX26胺基酸序列（Val→Ile）的位點，可能不是通過影響角質形成細胞的增殖能力，發揮其易感基因的生物學效應，參與到銀屑病發病環節。
