鄭道瓊,男,博士,浙江大學教授、博士生導師。
基本介紹
個人經歷,研究方向,主講課程,學術成果,科研項目,工作研究項目,專利,近年代表論文,
個人經歷
2021年1月至今 浙江大學 海洋學院 教授
2017年1月至2020年12月 浙江大學 海洋學院 副教授
2014年4月至2016年12月 浙江大學 海洋學院 講師
2014年9月至2017年9月 美國杜克大學 微生物與分子遺傳系 訪問學者/博士後
2012年7月至2014年4月 浙江大學 生命科學學院 藥學博士後
2007年9月至2012年6月 浙江大學 生命科學學院 微生物學專業 博士
2003年9月至2007年6月 浙江師範大學 生化學院 學士
研究方向
微生物學;微生物基因資源與遺傳;基因組不穩定與進化
主講課程
海洋微生物學(本科生),高級分子生物學(研究生)
學術成果
科研項目
1. 海洋微生物與基因資源
分離篩選海洋環境來源的細菌與真菌;在解析其基因組與轉錄組的基礎上,闡明控制藥物合成的基因簇及代謝途徑;利用麴黴、酵母異源體系進行基因功能的驗證和產物最佳化表達;構建新型酵母模型對藥物機理(主要是抗腫瘤與抗氧化活性)進行深入探究。
2. 微生物基因組學與合成生物學
運用多種組學和分子生物學技術揭示微生物基因組進化的分子遺傳機制,重點闡釋基因組結構變異、基因水平轉移和有絲分裂重組在微生物細胞表型進化和特定工業優良性狀獲得中的作用。課題組已解析了200多株不同分離來源和品種的酵母的基因組特徵,並利用合成生物學等技術構建了多株性能優良(高脅迫耐性與轉化率)的工業酵母菌株,並在生物燃料領域獲得實際套用,取得了良好的經濟社會效益。同時,課題組也在積極探索以酵母為底盤生物搭建異源代謝途徑發酵獲得多種藥物中間體的生產體系。
3.DNA損傷修復與基因組不穩定機理
基因組DNA損傷與基因組不穩定是腫瘤等重大遺傳疾病發生的重要誘因。課題組以釀酒酵母為模式生物,揭示了多種內在(DNA複製壓力、胞內代謝失衡、重要功能基因突變等)和外在誘因(環境脅迫因子、藥物和污染物)對基因組不穩定(雜合性丟失、染色體畸變重組和點突變)的影響機制,為闡明疾病發生機理及治療策略的制定提供重要參考。該方向的研究與美國科學院院士Thomas D. Petes等學者有著密切的合作。
上述研究工作已在《PNAS》、《Nucleic Acids Research》、《mBio》、《Appl Environ Microbiol》、《BMC Genomics》、《Appl Microbiol Biotechnol》和《Bioresour Technol》等權威SCI刊物上發論文30餘篇,累計影響因子為120+,引用480餘次;授權國家發明專利4項。
工作研究項目
[1] DNA聚合酶Polε在維持基因組穩定性中的作用, 浙江省自然科學基金, LY18C060002,10萬元,2018/01-2020/12,鄭道瓊,張珂,祁蕾,隋陽,王鈺婷。
[2] 水平基因轉移對釀酒酵母基因組進化和表型性狀的影響,縱向,國家自然科學基金委員會,31401058,24萬元,2015/01-2017/12,鄭道瓊,王品美,沈琦,張珂,高克慧,張幸,張黎傑
[3] 基因組變構改進酵母耐性脅迫等複雜表型的分子機理,縱向,國家自然科學基金委員會,31370132,78萬元,2014/01-2017/12, 吳雪昌,鄭道瓊,錢朝東,李歐,朱亮,魯翠,劉傲,張珂,高克慧
[4] 酵母培養新技術體系的創建及其在酒精生產節能降耗套用研究,橫向,河南天冠燃料乙醇有限公司,330萬元,2010/12-2013/12,吳雪昌,李歐,文艷苹,鄭道瓊,劉天喆,王品美
[5] 纖維素水解液高耐性酵母的功能基因組學研究,縱向,2013M531450,中國博士後科學基金會,5萬元,鄭道瓊
[6] 工業釀酒酵母新功能基因的挖掘及運用,車用生物燃料技術國家重點實驗室,橫向,5萬元,2015/09-2017/09,鄭道瓊
[7] 釀酒酵母菌株南陽1308的基因組測序和比較分析,2013013,橫向,車用生物燃料技術國家重點實驗室,3萬元,2013/3-2014/7,鄭道瓊
[8] 基因組結構變異對酵母黃酒發酵性能和品質的影響,縱向,BSH1301026,浙江省人保廳,5萬元,2013/6-2014/6,鄭道瓊
專利
[1]一種提高細菌多糖產量及粘度的培養方法,發明專利,201310237997.8.
[2]一株適合濃醪發酵的釀酒酵母菌株及其套用,發明專利,201110293252.4.
[3] 釀酒酵母ZG27(MATa/alpha)及其套用, 發明專利, 201410452782.4.
[4] 一種提高釀酒酵母乙酸耐受性的方法,發明專利,201410453817.4.
近年代表論文
[1]Yang Sui, Lei Qi, Ke Zhang, Natalie Saini, Leszek J. Klimczak, Cynthia J. Sakofsky, Dmitry A. Gordenin, Thomas D. Petes*,Dao-Qiong Zheng*. Analysis of APOBEC-induced mutations in yeast strains with low levels of replicative DNA polymerases.Proc Natl Acad Sci U S A, 117(17), 2020.
[2]Ke Zhang,Dao-Qiong Zheng*,Yang Sui, Lei Qi, Thomas D. Petes*. Genome-wide analysis of genomic alterations induced by oxidative DNA damage in yeast. Nucleic Acids Research, 47(7), 2019.
[3]Lei Qi1, Ke Zhang1, Yu-Ting Wang, Jian-Kun Wu, Yang Sui, Xiao-Zhuan Liang, Lin-Zi Yu, Xue-Chang Wu, Pin-Mei Wang, Jin-Zhong Xu andDao-Qiong Zheng*.Global analysis of furfural-induced genomic instability using a yeast model. Applied and Environmental Microbiology. 85(18), 2019.
[4]Huan Sheng, Lei Qi, Yang Sui, Yu-Zhe Li, Ke Zhang, Jin-Zhong Xu, Pin-Mei Wang*,Dao-Qiong Zheng*. Mapping chromosomal instability induced by small-molecular therapeutics in a yeast model. Applied Microbiology and Biotechnology. 103(12), 4869-4880, 2019.
[5]Dao-Qiong Zheng*, Thomas D. Petes*. Genome instability induced by low levels of replicative DNA polymerases in yeast.Genes, 9(11):53, 2018.
[6]Ke Zhang, Xue-Chang Wu,Dao-Qiong Zheng*, Thomas D. Petes*. Effects of temperature on the meiotic recombination landscape of the yeastSaccharomyces cerevisiae. Mbio, 8(6), 2017.
[7]Ke Zhang, Ya-Nan Di, Lei Qi, Yang Sui, Ting-Yu Wang, Li Fan, Zhen-Mei Lv, Xue-Chang Wu, Pin-Mei Wang,Dao-Qiong Zheng*. Genetic characterization and modification of a bioethanol-producing yeast strain.Applied Microbiology and Biotechnology. 102(5):2213-2223, 2018.
[8]Ke Zhang, Ya-Hong Fang, Ke-Hui Gao, Yang Sui,Dao-Qiong Zheng*, Xue-Chang Wu. Effects of genome duplication on phenotypes and industrial applications ofSaccharomyces cerevisiaestrains.Applied Microbiology and Biotechnology, 101(13):5405-5414, 2017.
[9]Dao-Qiong Zheng,Xin-Na Jin, Ke Zhang, Yang-Hong Fang, Xue-Chang Wu. Novel strategy to improve vanillin tolerance and ethanol fermentation performances ofSaccharomycere cerevisiaestrains. Bioresource Technology, 231, 53-58, 2017.
[10]Dao-Qiong Zheng, Ke Zhang, Xue-Chang Wu, Mieczkowski, P. A., & Petes, T. D*. Global analysis of genomic instability caused by DNA replication stress inSaccharomyces cerevisiae. Proceeding of the National Academy of Science, 113(50), E8114-E8121, 2016.
[11]Xue-Chang Wu, Li-Jie Zhang, Xin-Na Jin, Ya-Hong Fang, Ke Zhang, Lei Qi,Dao-Qiong Zheng*. Deletion ofJJJ1improves acetic acid tolerance and bioethanol fermentation performance ofSaccharomyces cerevisiaestrains. Biotechnology Letters, 38 (7), 1097-1106, 2016.
[12]Ke Zhang, Li-Jie Zhang, Ya-Hong Fang, Xin-Na Jin, Lei Qi, Xue-Chang Wu,Dao-Qiong Zheng*. Genomic structural variation contributes to phenotypic change of industrial bioethanol yeastSaccharomyces cerevisiae,FEMS Yeast Research, 16, fov118, 2016.
[13] Dao-Qiong Zheng, Tian-Zhe Liu, Jie-Chen, Ke Zhang, Ou Li, Liang Zhu, Yu-Hua Zhao, Xue-Chang Wu*, and Pin-Mei Wang*. Comparative functional genomics to reveal the molecular basis of phenotypic diversities and guide the genetic breeding of industrial yeast strains, Applied Microbiology and Biotechnology, 97, 2067-2076, 2013.
[14] Dao-Qiong Zheng,Pin-Mei Wang, Jie Chen, Ke Zhang, Tian-Zhe Liu, Xue-Chang Wu*, Yu-Dong Li*, and Yu-Hua Zhao. Genome sequencing and genetic breeding of a bioethanolSaccharomyces cerevisiaestrain YJS329, BMC Genomics, 13, 1-13, 2012.
[15]Dao-Qiong Zheng,Xue-Chang Wu*, Xiang-Lin Tao, Pin-Mei Wang, Ping Li, Xiao-Qin Chi, Yu-Dong Li, Qing-Feng Yan, and Yu-Hua Zhao. Screening and construction ofSaccharomyces cerevisiaestrains with improved multi-tolerance and bioethanol fermentation performance, Bioresource Technology, 102, 3020-3027, 2011.
[16] Dao-Qiong Zheng, Xue-Chang Wu*, Pin-Mei Wang, Xiao-Qin Chi, Xiang-Lin Tao, Ping Li, Xin-Hang Jiang, and Yu-Hua Zhao. Drug resistance marker-aided genome shuffling to improve acetic acid tolerance inSaccharomyces cerevisiae, Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 38, 415-422, 2011.
[17] Dao-Qiong Zheng,Jie Chen, Ke Zhang, Ke-Hui Gao, Ou Li,Pin-Mei Wang,Xiao-Yang Zhang, Feng-Guang Du, Pei-Yong Sun, Ai-Min Qu, Shuang Wu, and Xue-Chang Wu*. Genomic structural variations contribute to trait improvement during whole-genome shuffling (WGS) of yeast,Applied Microbiology and Biotechnology,98, 3059-3070, 2014.
[18]Dao-Qiong Zheng, Ke Zhang, Kei-Hui Gao, Ze-Wei Liu, Xing Zhang, Ou Li, Jian-Guo Sun, Xiao-Yang Zhang, Feng-Guang Du, Pei-Yong Sun, Ai-Min Qu, and Xue-Chang Wu*. Construction of novel active dry yeast (ADY)Saccharomyces cerevisiaestrains for bioethanol fermentation,PLoS ONE,8 (12): e85022, 2013
[19]KeZhang,MengmengTong,KehuiGao,YananDi,PinmeiWang,ChunfangZhang,XuechangWu,DaoqiongZheng*. Genomic reconstruction to improve bioethanol and ergosterol production of industrial yeastSaccharomyces cerevisiae. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 42 (2), 207-218, 2015.
[20]Pin-Mei Wang,Dao-Qiong Zheng(Co-first author),Xiao-Qin Chi, Ou Li, Chao-Dong Qian, Tian-Zhe Liu, Xiao-Yang Zhang, Feng-Guang Du, Pei-Yong Sun, Ai-Min Qu, and Xue-Chang Wu*.Relationship of trehalose accumulation with ethanol fermentation in industrialSaccharomyces cerevisiaeyeast strains, Bioresource Technology,152, 371-376, 2014.