鄂爾多斯市退耕還林工程管理中心是鄂爾多斯市林業局直屬單位。
2000年,國家開始組織實施退耕還林和天然林保護為主的重點生態建設工程,鄂爾多斯市林業局根據國務院、自治區人民政府制定的有關政策要求,在市林業局設立了退耕辦和天保辦,並與國有林場管理科合署辦公,行政編制。2002年11月11日經鄂爾多斯市機構編制委員會批准正式成立了鄂爾多斯市退耕還林工程管理中心,隸屬市林業局直屬事業單位,市財政全額撥款,科級建制,核定人員編制14人,科級領導職數2名(1正1副)。2010年被批准為參照公務員法管理單位。2013年3月,鄂爾多斯市退耕還林工程管理中心人員編制由14人調整為13人。現有工作人員13人,正科1人、副科1人、副主任科員2人、科員8人、機關工勤1人。其中,高級工程師5人,工程師5人,高級技師1人,助理工程師2人。