郝沛(中國科學院上海巴斯德研究所研究組長)

郝沛(中國科學院上海巴斯德研究所研究組長)

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郝沛,女,博士,上海市青年科技啟明星、中科院青促會會員、中國科學院盧嘉錫青年人才,中國科學院上海巴斯德研究所研究員、博士生導師。

現任中國科學院上海巴斯德研究所研究組長,婦委會主任 。

基本介紹

人物經歷,研究方向,所獲榮譽,

人物經歷

1997年畢業於上海交通大學電子工程專業,2008年復旦大學生物信息專業博士畢業。2001年5月至2002年9月與中科院上海生命科學院國家基因中心合作,開發了基因組注釋系統平台,並參與了水稻第四號染色體的注釋統計分析工作,作為並列第一作者相關結果發表在《自然》上;2002年9月和中科院上海生命科學院蛋白質組學重點實驗室合作從事蛋白注釋平台開發、實驗室信息管理系統開發等工作,作為第一作者相關工作發表在《Bioinformatics》上。2003年4月SARS爆發後又參與了趙國屏教授組織的中國SARS研究小組的工作,作為並列第一作者相關結果發表在《科學》、《PNAS》、《JBC》,並獲得了 (排名第四)。2013年參與了H7N9的發現以及耐藥株變遷的研究工作,相關成果分別發表在《New Eng J Med》和《Lancet》。2003年至2008年還主持中英合作項目 Knowledge Discovery Edition平台在生物信息學的套用開發。

研究方向

主要從事計算生物學/生物信息學領域的交叉前沿研究,充分發揮計算機科學背景,在以下三個方面進行研究:在病毒分子進化、致病機制、和耐藥性突變規律研究方面,建立關鍵突變位點的檢索算法,病毒致病性的網路模型、和分子動力學模擬評估傳播宿主的方法,並進行臨床表型關聯分析;對SARS病毒和新型H7N9禽流感病毒的分子進化、病毒宿主變遷、和臨床診斷分型及治療具有重大指導意義;推廣生物信息學方法在病原微生物檢測預防和抗藥性突變評估的轉化套用,建立了一批流行性病毒突變資料庫和檢索分析工具平台;多維組學數據Meta-分析算法探索及套用,開發完成了高通量轉錄組數據的組裝算法的最佳化模擬、基於組學功能模組的小分子功能表型搜尋比對算法、和基因組水平的基因穩定性/敏感性meta-評估算法。

所獲榮譽

曾獲得上海市自然科學一等獎、上海市青年科技啟明星、民治乳業科學獎、中國科學院盧嘉錫青年人才獎
2020年9月,被授予“抗擊新冠肺炎疫情全國三八紅旗手”榮譽稱號。
2021年4月,榮獲全國五一巾幗標兵。

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