邱天祐,曾祖邱聲遠,祖父邱添德 ,父邱宗勉,嫡母佘氏,生母蘇氏,娶李氏,侄孫邱其仁,曾孫邱憲周。景泰五年(1454)正月二十九日生,行一。成化十六年(1480)福建鄉試第17名舉人,禮部會試271名,成化十七年(1481)王華榜三甲159名進士。授瑞安縣(今屬浙江)知縣。改饒平縣(今屬廣東)知縣,廉能卓著,重建中正堂,有政績。後丁憂去官,弘治七年(1494)十二月授直隸監察御史,彈劾不避權貴。後歷巡按廣西,復按陝西,弘治十一年(1498)曾劾宦官李廣招權納賄之罪。率同列抗疏極言,其略曰:“爵賞予奪,人主操柄也,出於公則治,出於私則亂。出於台閣則為公,出於近幸則為私”。忤旨,廷杖六十,下錦衣獄。尋得釋,又連劾李廣恃權縱恣,贓賄狼藉,未報。時清寧宮火災,李廣自殺,天祐與給事中華昹共檢出李廣家財數十百萬,疏籍沒之。弘治十七年(1504)十一月,丁憂服闋,由陝西道監察御史復除浙江道監察御史。其居台近十三年,以疾乞歸。弘治十二年,御史張敏在連江里象峰為邱天祐立“繡衣坊”。