《轉錄組進化分析的統計學框架及軟體開發》是依託復旦大學，由谷迅擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：轉錄組進化分析的統計學框架及軟體開發
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：谷迅
- 批准號：31571355
- 申請代碼：C0608
- 負責人職稱：教授
- 研究期限：2016-01-01 至 2019-12-31
- 支持經費：63（萬元）
項目摘要
高通量技術的發展為進化基因組學和表型組學的研究提供了難得的機遇。然而， 如何有效的利用這些數據來進行基因與表型相關的進化生物學研究依然存在大量的問題，特別是在如何連線數據驅動的分析方法和進化模型驅動的假設檢驗在大數據的背景下依然是一個嚴峻的挑戰。本項目旨在使用RNA-Seq數據系統性的建立轉錄組進化的統計學模型框架。主要在方法論上解決：1. 多個版本的表達距離的估算方法，以套用於不同的實際情形；2. 表達進化的分子鐘分析，以便檢測出發生了快速表達分化的系統發育樹分枝；3. 系統發育樹祖先節點的表達譜推斷； 4. 系統發育水平上的差異表達基因檢測。我們將整合本項目的研究結果，開發一套界面友好的軟體系統。本項目成果將填補轉錄組進化統計和分析軟體一項空白。
