基本介紹
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《複雜疾病的單體型關聯分析方法》是依託東北師範大學,由郭偉擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要分子生物技術的迅猛發展使得大規模測定標記基因型數據成為可能,利用標記信息對疾病,特別是複雜疾病的基因定位越來越受到生物統...
複雜疾病的基因關聯分析關鍵在於尋找和發現多個基因在病例和正常人之間統計分布的不同。單體型作為同一條染色體上不同位點的等位基因組成的序列,是基因位點之間連鎖不平衡(LD)或相依信息的有效載體,其分布在病例與對照組之間的差異反映了多個...
通過研究單體型,有望找到很多人類複雜疾病的誘病基因。在關聯研究中,由於很多基因數據與環境協變數的觀測很昂貴或者很困難,因而,研究人員往往只能對部分研究對象觀測其基因數據和環境協變數。在這種情況下,利用ODS抽樣這種有偏抽樣能提高...
(2)我們提出了這一種有次序的組合劃分降維方法,通過線性次運算得到全局最優解,大大降低了多因子降維法指數階的運算複雜度,從而為多基因互動作用分析提供了一種運算高效的分析方法。(3)多基因分析的一種途徑是通過單體型分析多個...
《複雜疾病遺傳學研究方法》是2009年科學出版社出版的圖書,作者是嚴衛麗。內容簡介 《複雜疾病遺傳學研究方法》是基於21世紀世界生物醫學領域發生的巨大進步和編者的研究積累而編寫的。人類基因組計畫的完成、單體型計畫的完成和全基因組關聯...
同時項目組在生物網路構建、基因組序列變異數據糾錯、基因組變異的單體型分型研究上也取得了顯著進展,我們利用平衡最佳化分區和兩位點連鎖加權圖構建了單體型重建的有效算法,為進一步研究基於單體型的全基因組關聯分析多基因互動作用探測算法研究...
對於兩個基因位點,我們將發展檢驗本質互動效應的統計方法並研究其性質,同時研究統計互動效應和生物互動效應的聯繫。對多位點基因,我們將發展基於單體型的有效的關聯檢驗方法;對於因引入多個啞變數導致的高維問題,將研究適用的變數選擇方法...
這是研究複雜疾病的遺傳機制的關鍵方法。然而存在的方法基本只是孤立地研究預先指定的單個基因或單體型與性狀的關係,並不能有效地分析包括遺傳因素間多種形式的互動作用在內的複雜疾病遺傳機制。本項目在具有範式 large p, small n 的高維...
項目促進了單體型計算模型及算法研究,項目的研究成果為生物信息學中大量複雜的計算問題的實用算法設計提供了新思路,也將促進單體型在複雜疾病全基因關聯分析中的套用。
對於數據存在誤判的問題,我們研究在誤判模型參數未知的情況下,雙重抽樣和反覆測量基因數據的統計分析方法,並將其套用於患病同胞對研究和一般的基因與疾病的關聯分析;對於不完全基因數據,研究以單體型和環境因素為變數的回歸分析的理論和...
二、常見變異常見病假說和罕見變異常見病假說 第二節複雜疾病的發病基礎 第三節複雜疾病易感基因定位的發展趨勢 一、候選基因研究 二、單體型分析 三、基於常見5NP和CNV的全基因組關聯研究 四、基於低頻變異位點的全基因組關聯研究 參考...
但是在奶牛的套用研究中存在缺乏SNP注釋信息和含有複雜系譜結構等諸多問題。因此,在青年基金的支持下,我們做了如下三項工作:一是綜合不同來源的注釋工具,構建了奶牛基因組SNP基因集資料庫及服務平台;二是開發了基於單體型的關聯分析方法...