《融合基因S-PSPH在鼻咽癌中臨床意義及功能研究》是依託中山大學,由王海雲擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:融合基因S-PSPH在鼻咽癌中臨床意義及功能研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:王海雲
- 依託單位:中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
鼻咽癌是常見的頭頸部惡性腫瘤之一, 大量的研究表明遺傳易感性、EB病毒感染和環境因素在鼻咽癌的發病過程中起著重要作用。絕大多數研究集中在鼻咽癌的SNP分析、缺失/插入等,然而融合基因在鼻咽癌發生髮展中的作用還不清楚。我們在前期研究中,套用RNA轉錄組測序篩選與鼻咽癌相關的融合基因。研究結果發現在6/10個鼻咽癌石蠟樣本存在7號染色體S和PSPH融合。該融合基因S-PSPH在鼻咽癌中的臨床意義及功能還不清楚。本研究旨在通過構建S-PSPH表達質粒,分別在細胞和動物水平研究該融合基因對鼻咽癌細胞增殖,細胞周期、細胞凋亡、轉移的影響;對裸鼠鼻咽癌成瘤能力和轉移的影響;採用qPCR技術和Sanger測序分析融合基因S-PSPH對鼻咽癌患者生存預後,放化療敏感性以及病理形態學方面的相關性。該研究發現將為鼻咽癌患者個性化防治提供新的分子靶點。
結題摘要
鼻咽癌是常見的頭頸部惡性腫瘤之一, 具有極其不平衡的地域分布特點。大量的研究表明遺傳易感性、EB病毒感染和環境因素在鼻咽癌的發病過程中起著重要作用。絕大多數研究集中在鼻咽癌的SNP分析、缺失/插入等,然而融合基因在鼻咽癌發生髮展中的作用還不清楚。在我們的研究中,套用RNA轉錄組高通量測序篩選與鼻咽癌相關的融合基因。研究結果發現在6/10個鼻咽癌石蠟樣本存在7號染色體SEPT7P2和PSPH融合。採用sanger直接測序法證實了融合基因SEPT7P2-PSPH屬於染色體內融合,且上下游基因距離為10.2Mb。我們依據上下游基因的DNA序列各設計15對引物以覆蓋上下游基因全長,採用PCR擴增融合基因高表達的鼻咽癌細胞株DNA,PCR結果證實能擴增全長,證實該融合基因沒有發生染色體倒位,而是不同轉錄本之間的順式剪下方式的新型融合基因。敲低融合基因,轉染至細胞系,融合基因低表達的腫瘤細胞增殖能力,克隆形成以及侵襲轉移能力均增強(P<0.005)。檢測下游基因PSPH在鼻咽癌石蠟組織中表達,Kaplan-Meier分析高表達的鼻咽癌患者的無瘤生存時間和總生存時間均要小於低表達的患者。該研究發現鼻咽癌中一種新型的融合基因類型存在,並且在鼻咽癌的轉移中起著促進作用,為鼻咽癌患者的預後預測提供新的分子靶點。