蛋白質資料庫

蛋白質資料庫是指包括蛋白質信息的資料庫。常用的蛋白質資料庫有很多,其中Uniprot被認為收錄最廣泛和注釋信息最全面的蛋白質資料庫。Uniprot下包括Swiss-Prot、Tr...

生物大分子三維空間結構資料庫是一類重要的生物信息學資料庫。蛋白質結構資料庫(ProreinData Bank,PDB)是1971年創建的國際上最著名、最完整的蛋白質三維結構資料庫...

蛋白質序列資料庫指套用計算機功能分析生物學信息的資料庫。套用計算機的運算法則,比較DNA和蛋白質序列而檢測結構、功能和序列之間的進化關係。各種基因組的序列產生...

蛋白質結構資料庫(Protein Data Bank,簡稱PDB)是美國紐約Brookhaven國家實驗室於1971年創建的。為適應結構基因組和生物信息學研究的需要,1998年10月由美國國家科學...

相互作用的蛋白質資料庫(DIP)收集了由實驗驗證的蛋白質-蛋白質相互作用。資料庫包括蛋白質的信息、相互作用的信息和檢測相互作用的實驗技術三個部分。用戶可以根據...

OWL是一個非冗餘的蛋白質序列資料庫,是由Leeds大學和Warrington的Daresbury實驗室合作開發的(Bleasby等,1994)。OWL資料庫由四個主要的一級序列資料庫複合而成,即...

布魯克海文蛋白質資料庫(The BrookHaven Protein Data Bank,PDB)是經實驗測定的生物大分子三維結構數據檔案,服務於全球科研、教育工作者和學生。其內容包括原子坐標、...

分子資料庫生物信息學涉及的資料庫可大致分為二種:初級資料庫和二級資料庫。初級 資料庫貯存原始的生物數據,如 DNA 序列,由晶體衍射(Crystallography)獲得 的蛋白質...

DIP(Database of Interacting Protein),也叫蛋白互作資料庫,是研究生物反應機制的重要工具。...

PIR國際蛋白質序列資料庫是由蛋白質信息資源(PIR)、慕尼黑蛋白質序列信息中心(MIPS)和日本國際蛋白質序列資料庫(JIPID)共同維護的國際上最大的公共蛋白質序列資料庫...

若聯合其他的蛋白質屬性,如胺基酸組分分析、肽質質量、表現蛋白質分子量、等電點,可以更加可信地鑑定蛋白質。選擇BLAST程式,可與資料庫相配比。目前,採用一種Tagl...

蛋白質資料庫(Protein Data Bank,PDB)[1] 是一個生物大分子(如蛋白質和核酸)資料庫, 內容包括由全世界生物學家和生物化學家上傳的蛋白質或核酸的X光晶體衍射...

蛋白質共價修飾組學資料庫是" 十一五" 中國科學院信息化專項,由中國科學技術大學生命科學學院承擔,並與華中科技大學、大連化物所以及美國多倫多大學合作構建的專業...

專門存儲蛋白質和核酸分子結構的蛋白質資料庫中,接近90%的蛋白質結構是用X射線晶體學的方法測定的。X射線晶體學可以通過測定蛋白質分子在晶體中電子密度的空間分布,...

年中國科學院上海生命科學研究院申請的院重大項目《模式生物與細胞等功能系統的系統生物學研究》的數據支持而開展的,對該項目中轉錄組和蛋白質組產生的數據管理,集成...

截至到2008年2月,蛋白質資料庫中已存有接近50,000個原子解析度的蛋白質及其相關複合物的三維結構的坐標。[4]蛋白質研究方法 蛋白質是被研究得最多的一類生物分子...

SWISS-PROT是含有詳細注釋內容的蛋白質序列資料庫,由歐洲生物信息學中心(EBI)維護,目前已合併入 UniProt資料庫,旨在幫助基因組和蛋白質組以及相關的分子生物學研究...

可使吸附在蛋白質晶片上的靶蛋白離子化,在電場力的作用下計算出其質量電荷比,與蛋白質資料庫配合使用,來確定蛋白質片段的分子量和相對含量,可用來進行檢測蛋白質譜...

基因和基因組的資料也包含在DNA資料庫中。目前國際上比較重要的核酸(含蛋白質)一級資料庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個資料庫信息共享,每日交換...

6.4 蛋白質資料庫6.5 基因融合和複製6.6 二級結構預測6.7 基因組學與蛋白質組學6.8 概要6.9 問題7 酶的動力學、結構、功能與催化作用...

APD資料庫(antimicrobial peptide database——專門收錄抗菌肽的資料庫。...... 該資料庫綜合了蛋白質銀行資料庫 (PDB), Swiss-Prot 蛋白質知識庫(Swiss-Prot Prot...

蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究...從而得到蛋白質的定性數據;這些數據可以用於構建資料庫或和已有的資料庫進行比較...

其它一些資料庫的數據涵蓋了DNA 序列,RNA序列,蛋白序列,蛋白質二級結構,蛋白質三級結構,基因突變體,生物代謝途徑等方面。門類齊全的網路資料庫正在為生物學的研究...