整個胃腸道黏膜有抗結核桿菌侵襲的作用.只有當長期接觸大量結核桿菌,如空洞型肺結核,才可能侵入胃腸道黏膜.在牛型結核病常見的國家,可因吃污染的奶製品而發生口腔或口咽部潰瘍,也可發生小腸的原發性病變.在已開發國家明顯的小腸受累罕見,但在開發中國家這仍是一個問題.腸道受侵犯往往產生增生性病變(腸炎症性綜合徵),該病往往因懷疑癌腫作剖腹探查時確診.單純的切除術然後再給予化療可獲良好效果.