網際網路藥品交易運營商必須獲得國家食品藥品監督管理局頒發的《從事網際網路藥品交易服務資格證書》，才能從事網際網路藥品交易服務。還必須嚴格按照《藥品管理法》、《藥品管理法實施條列》、《藥品流通監管辦法》（局令地26號）、《網際網路藥品信息服務管理辦法》（局令第9號）等相關規定從事網際網路藥品交易。
在行業內比較（都有證書賣藥有區別嗎？）
目前，在國家藥監局備案的醫藥類信息網站有1700多家，其中獲得國家批准的藥品交易網站分類如下：
（一）“C”字號：藥房藥店網上售藥屬於B2C形式，國家批准文號為浙C（浙江省）、豫C（河南省）。網上零售本藥房的藥品。
（二）“B”字號：醫藥企業自有產品網上批發銷售的，也屬於B2B形式，國家批文為浙B（浙江省）、豫B（河南省）。企業自有產品對外批發銷售。
（三）“A”字號：獨立的第三方線上交易（B2B），國家批准文號為國A開頭的，全國的製藥廠、醫藥公司、醫院、藥房都可以在這網站買賣藥品。全國各地的賣家和買家都可以買賣，為買家和賣家提供了無限的空間。目前，國A牌照的企業共有六家，其中五家做藥品招標業務，其中有一家做網上藥品交易業務，網上批發藥品。
與行業外比較（其他電子商務為何不能銷售藥品？）
與其他B2B交易網相比，他們在沒有獲得國家藥監局批准之前，是不能從事藥品網上交易的，國家將加大網際網路藥品網上交易監管力度，打擊無證經營。
