磁共振成像(MRI)是根據有磁距的原子核在磁場作用下，能產生能級間的躍遷的原理而採用的一項新檢查技術，MRI有助於檢查癲癇患者腦的能量狀態和腦血流情況，對變性病診斷價值很大。
MRI是通過體外高頻磁場作用，由體內物質向周圍環境輻射能量產生信號實現的，成像過程與圖像重建和CT相近，只是MRI既不靠外界的輻射、吸收與反射，也不靠放射性物質在體內的γ輻射，而是利用外磁場和物體的相互作用來成像，高能磁場對人體無害。
臨床常用MRI檢查發現繼發性癲癇的腦結構變化，如果臨床對癲癇綜合徵分類不明，MRI能明確該患者是否由腦結構改變所致，顱內腫瘤常引起癲癇，MRI對腦內低度星形膠質細胞瘤、神經節、神經膠質瘤、動靜脈畸形和血腫等的診斷確認率極高。MRI能清楚地顯示癲癇患者的腦萎縮，對腦實質和腦脊液的顯示度極好。
MRI與CT比較，其主要優點是：
①離子化放射對腦組織無放射性損害，也無生物學損害。
②可以直接做出橫斷面、矢狀面、冠狀面和各種斜面的體層圖像。
③沒有CT圖像中那種射線硬化等偽影。
④不受骨像干擾，對後顱凹底和腦幹等處的小病變能滿意顯示，對顱骨頂部和矢狀竇旁、外側裂結構和廣泛轉移的腫瘤有很高的診斷價值。
⑤顯示疾病的病理過程較CT更廣泛，結構更清楚。能發現CT顯示完全正常的等密度病灶,特別能發現脫髓鞘性疾病、腦炎、感染性脫髓鞘、缺血性病變及低度膠質瘤。
