《疾病相關RNA剪接因子的體內功能研究》是依託中南大學，由馬龍擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：疾病相關RNA剪接因子的體內功能研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：馬龍
- 依託單位：中南大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
RNA剪接是真核基因表達的主要調控機制。剪接因子的突變會導致嚴重的疾病，包括脊髓肌肉萎縮症(SMA)，視網膜色素變性(RP)等。目前，對許多剪接因子的功能和突變致病的分子機制了解非常有限。利用我們建立的研究線蟲體內RNA剪接的遺傳學工具，最近我們發現SMA和RP的相關致病基因smn-1和prp-8,以及一個抑癌剪接因子相關基因T08B2.5都和剪接因子U2AF大亞基基因uaf-1相互作用，為研究這些基因的體內功能提供了新的切入點。為了深入了解smn-1, prp-8和T08B2.5如何調控RNA剪接，我們計畫研究smn-1和uaf-1相互作用的分子機制，鑑定prp-8和T08B2.5的遺傳突變，闡明這些突變如何影響uaf-1的功能，最後探索smn-1,prp-8和T08B2.5之間可能存在的相互作用關係。通過這些工作，我們希望進一步認識這些剪接因子的體內功能和相關疾病的可能發病機理。
結題摘要
RNA剪接是真核基因表達的主要調控機制之一。剪接因子的突變會導致嚴重的疾病，包括脊髓肌肉萎縮症(SMA)，視網膜色素變性(RP)等。目前，我們對許多剪接因子的功能和突變致病的分子機制了解依然非常有限。因此，我們的一個長期研究方向是探索RNA剪接的體內調控和疾病相關基因的功能。在之前的研究中，我們發現SMA和RP的相關致病基因smn-1和prp-8，以及一個抑癌剪接因子相關基因T08B2.5（rbm-5）都和剪接因子U2AF大亞基基因uaf-1相互作用。研究這些RNA剪接因子的體內功能將有助於深入了解RNA剪接及其相關疾病的分子生物學機制，在過去的四年中，我們在自然科學基金委的資助下成功完成了項目的計畫工作。取得的成果主要包括兩方面：第一，克隆鑑定了線蟲的兩個高度保守的剪接因子基因rbm-5和prp-8，研究了這兩個剪接因子基因和關鍵剪接因子基因uaf-1的相互作用，並對rbm-5調控選擇性剪接的分子機制進行了深入分析。第二，為了解SMN-1如何影響mRNA剪接和表達，我們檢測了SMA缺陷表型剛出現時的野生和smn-1(ok355)突變線蟲轉錄組，發現smn-1(ok355)突變導致廣泛的基因表達改變。KEGG分析表明差異表達基因主要富集於神經配體-受體相互作用、吞噬體和癌症相關信號等途徑，提示我們這些途徑可能和smn-1的功能有關。我們用qRT-PCR驗證了其中的一些基因表達變化。以上工作有助於我們進一步認識這些剪接因子的體內功能和相關疾病的可能發病機理。
