BioModels Database是一個完全免費的，用來存儲和交流數量型生物模型的資料庫。 當前生物模型資料庫得到自然出版集團(Nature Publishing Group)和PLoS的推薦和支持。
基本介紹
- 中文名：生物模型資料庫
- 外文名：BioModels Database
- 上傳格式：SBML和CellML
- 主要存儲：數量型生物化學模型
簡介,學術期刊的支持,研發與維護機構,研發資金來源,
簡介
BioModels Database是一個完全免費的，用來存儲和交流數量型生物模型的資料庫。當前生物模型資料庫得到自然出版集團(Nature Publishing Group)和PLoS的推薦和支持。
BioModels Database是一個免費的生物模型線上資料庫。資料庫中主要存儲數量型生物化學模型。所有的模型都是在相關的科學文章中發表過的並且經過了同行評審。
所有BioModels Database中的模型都是已經發表在各種學術刊物上的，並且被驗證人員用模擬軟體模擬驗證過的。所有模型中的元素都被連線到相關參考資料庫，方便用戶快速獲得相關詳細信息。
生物學家可以以SBML和CellML兩種格式上傳生物模型。當模型上傳後，會自動轉換為以下格式供生物學家下載使用：SBML, CellML, XPP, SciLab, BioPAX和一些圖形格式，如GIF, SVG和applet。
學術期刊的支持
當前BioModels Database得到很多期刊的支持。當一個生化模型的科研人員在發表關於生化模型的學術文章前，這些期刊會推薦作者將模型存在BioModels Database里。當文章發表時，讀者便可以直接從BioModels Database中下載模型。目前，支持BioModels Database的期刊包括自然出版集團(Nature Publishing Group)的Molecular Systems Biology、PLoS的所有期刊、BioMed Central的所有期刊和Royal Society of Chemistry的所有期刊。
研發與維護機構
BioModels Database由以下機構合作開發：位於英國劍橋的歐洲生物信息研究所（EBI）的運算神經生物學組(Computational Neurobiology Group)；美國加利福尼亞Keck Graduate Institute的SBML組和日本Systems Biology Institute以及 JWS Online, Stellenbosch University, ZA。
目前BioModels Database主要由歐洲生物信息研究所的BioModels.net團隊負責維護。
研發資金來源
BioModels Database的研發得到以下組織的資助：歐洲分子生物實驗室（European Molecular Biology Laboratory）和美國National Institute of General Medical Sciences。
