《生物序列資料庫數據模型、索引、體系結構研究》是依託復旦大學,由朱揚勇擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:生物序列資料庫數據模型、索引、體系結構研究
- 依託單位:復旦大學
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:朱揚勇
- 申請代碼:F0202
- 批准號:60573093
- 支持經費:23(萬元)
- 研究期限:2006-01-01 至 2008-12-31
- 負責人職稱:教授
《生物序列資料庫數據模型、索引、體系結構研究》是依託復旦大學,由朱揚勇擔任項目負責人的面上項目。
《生物序列資料庫數據模型、索引、體系結構研究》是依託復旦大學,由朱揚勇擔任項目負責人的面上項目。項目摘要隨著生物測序技術的發展,以DNA序列和蛋白質序列為主的生物序列數據呈指數級增長,由於生物序列包含大量的語義信息,很難...
《生物序列分析》是2010年科學出版社出版的圖書,作者是Richard Durbin。內容簡介 《生物序列分析》在結構上大致可以分為四個部分,每個部分所覆蓋的問題分別是:二序列聯配、多序列聯配、系統發育樹和RNA結構,具體分為:二序列聯配、...
其它生物資料庫,包括RNA資料庫、線粒體資料庫、基因表達資料庫、密碼子資料庫、蛋白質三維結構資料庫和霉一代謝資料庫等等。當前問題 序列數據庫的繁瑣冗長增加了科學家們要使用這些資源時的困難 某個生物學家要獲取一個關於果蠅的核酸...
SRS序列查詢系統通過超文本連結將DNA序列資料庫和蛋白質序列、功能位點、結構、基因圖譜以及文獻摘要MEDLINE等各種資料庫聯繫在一起。利用EBI網站提供的BLAST或FastA程式,可以對EMBL資料庫進行未知序列同源性搜尋。DDBJ 是DNA Data Bank of ...
歐洲分子生物學實驗室英國Hinxton分站EBI(European Bioinformatics Institute,歐洲生物信息學研究所),與世界上其他分子生物學資料庫進行合作研究,最主要的有EMBL核酸序列資料庫,後參與了與日內瓦大學共同進行的SWISS-PROT的建設。在SWISS-...
研究 SWISS-PROT中儘可能減少了冗餘序列,並與其它30多個數據建立了交叉引用,其中包括核酸序列庫、蛋白質序列庫和蛋白質結構庫等。SWISS-PROT資料庫包含了EMBL核酸序列資料庫中被經過仔細檢查和準確注釋了的蛋白質序列,一般地,任何蛋白質...
蛋白質序列資料庫的雛形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初,美國國家生物醫學研究基金會(National Biomedical Research Foundation,簡稱NBRF)Dayhoff領導的研究組將蒐集到的蛋白質序列和結構信息以“蛋白質序列和結構地圖集”(Atlas of...
其研究重點主要體現在基因組學(Genomics)和蛋白質組學(Proteomics)兩方面,具體說就是從核酸和蛋白質序列出發,分析序列中表達的結構功能的生物信息。定義 一.生物信息學是一門收集、分析遺傳數據以及分發給研究機構的新學科(...
CNGBdb是國內最大的生物大數據中心之一,整合了來源於國家基因庫、NCBI、EBI、DDBJ等平台的數據,包括文獻、變異、基因、蛋白質、序列、項目、樣本、實驗、測序、組裝10個結構的大量分子數據和其他信息,通過CNGBdb搜尋建立索引,並將這些數據...
其中第一章介紹了生物信息學的發展歷史和該書的主要內容;第二章介紹了常用的序列資料庫資源及如何從資料庫中獲取序列數據;第三章介紹了序列比對的基本概念、經典的序列比對算法以及有關序列對工具的使用方法等;第四章介紹基因結構的...
3.2.1 核酸序列基本資料庫 28 3.2.2 核酸序列二級資料庫 29 3.3 蛋白質序列資料庫 30 3.3.1 蛋白質序列基本資料庫 30 3.3.2 蛋白質序列二級資料庫 34 3.4 生物大分子結構數據庫 42 3.4.1 生物大分子結構基本資料庫 ...
《生物數據分析和生物系統模型中的參數估計》是在作者對時間序列基因表達數據和非線性動態生物系統參數估計領域的研究論文基礎上完成的,它包括5個部分:第1部分給出了本書的研究背景和結構綱要;第2部分包括5章,每章介紹一個時間過程的...
研究生物系統組成成分的構成與相互關係的結構、動態與發生,以系統論和實驗、計算方法整合研究為特徵的生物學。20世紀中葉貝塔朗菲定義“機體生物學”的“機體”為“整體”或“系統”概念,並闡述以開放系統論研究生物學的理論、數學模型與...
CATH是另一個著名的蛋白質分類資料庫,由英國倫敦大學開發和維護。理論依據 20世紀60年代美國的Anfinsend小組作了牛胰核糖核酸酶變性及復現再摺疊的實驗和理論研究,提出蛋白質的胺基酸序列包含有足夠的信息去決定它的空間結構(並因此獲得...
總部位於德國海德堡,於1973年建立。分7個部分:結構、分化、物理儀器、生化儀器、生物儀器、計算機和套用數學。目前,在研究中已經建立了先進的核苷酸序列資料庫。EMBL除了位於德國海德堡(Heidelberg)的總部外在歐洲還有幾處分站:英國的茵...
[2] 2006.1- 2008.12 “生物序列資料庫數據模型、索引、體系結構研究”. (60573093) 國家自然科學基金. 項目負責人 [3] 2009.1-2010.12 “軍用計算機系統可測試性設計技術” 總裝備部預研項目 項目負責人 [4] 2008.3- 2009....