生物信息與數據處理

簡介

本書的目的在於通過對計算機和網際網路相關知識的介紹，使學生掌握網際網路生物資源獲取及分析方法，以增強學生自主學習能力，拓寬學生知識領域，為今後科研實踐打好基礎。本書作為講義已經過5輪教學實踐，具有系統性強、技術方法新、內容豐富、結構緊湊、實用性強等特點，適合於生物科學、生物技術及相關專業的本科生和研究生使用，也可供研究人員參考。

書籍目錄

第1章緒論

1.1 計算機在生命科學領域的套用

1.2 學習本課程的目的與意義

1.3 學習本課程的基本方法

第2章網際網路與網上生物學資源

2.1 網際網路概述

2.2 網際網路的相關概念、提供的服務類型和軟體

2.3 網上生物學信息資源分類

2.4 計算機檢索原理

2.5 計算機檢索基本原理

2.6 生物文獻檢索途徑

第3章搜尋引擎與生物學資源導航站點

3.1 Internet上WWW生物資源的查詢途徑

3.2 搜尋引擎的查詢方法

3.3 非WWW生物資源檢索途徑

3.4 網際網路涉及生物學習的資源介紹

3.5 引用Internet資源的注意事項

第4章網際網路上的生物學文獻資料庫

4.1 文獻搜尋引擎

4.2 生物相關文摘型資料庫

4.3 全文資料庫介紹

4.4 會議論文資料庫

4.5 學位論文資料庫

4.6 專利資料庫

4.7 標準資料庫

4.8 獲取原文的方法總結

第5章特定文獻資料庫的構建

5.1 文獻管理軟體的共同特點

5.2 Reference Manager軟體的使用

5.3 國產文獻管理軟體——醫學文獻王簡介

第6章文獻閱讀與綜述撰寫

6.1 文獻閱讀的意義和方法

6.2 科技綜述的寫作

第7章常用核酸蛋白質資料庫介紹

7.1 常用核酸和蛋白質資料庫及檔案格式

7.2 其他注釋序列資料庫

7.3 基因組和特殊物種資料庫

7.4 其他資料庫

第8章生物資料庫檢索

8.1 利用SRS(序列檢索系統)搜尋資料庫

8.2 利用Entrez進行資料庫搜尋

8.3 DBGET/LinkDB

第9章以序列相似性為準則的資料庫搜尋

9.1 序列相似性搜尋

9.2 胺基酸取代矩陣

9.3 資料庫搜尋：FASTA和BLAST

9.4 序列過濾

9.5 反覆資料庫搜尋和PSl—BLAST

第10章 PRISM統計分析軟體的使用

10.1 常用統計軟體介紹

10.2 GraptlPad Prism使用介紹

上機實驗

實驗1 常用搜尋引擎及專業搜尋引擎的使用

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基本介紹

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