西安電子科技大學計算生物信息學研究所

西安電子科技大學計算生物信息學研究所

針對高通量的生物網路數據,西安電子科技大學計算生物信息學研究所研究的重點集中在圖模型及其相關的圖論與組合最佳化算法、數據挖掘與機器學習算法等。

基本介紹

  • 中文名:西安電子科技大學計算生物信息學研究所
  • 外文名:Computational Bioinformatics
  • 特點:以生物數據作為研究對象
  • 學科帶頭人:高琳
簡介,學科帶頭人,研究方向,計算生物信息學,數據挖掘技術及套用,圖論與組合最佳化算法及套用,

簡介

計算生物信息學()是生命科學與計算機科學、數理科學、化學等領域相互交叉而形成的一門新興學科,以生物數據作為研究對象,研究理論模型和計算方法,開發分析工具,進而達到揭示這些數據蘊含的生物學意義的目的。

學科帶頭人

高琳,女,博士,西安電子科技大學計算機學院教授,學術帶頭人,博士生導師。西安交通大學數學系計算數學專業理學學士學位、西北大學數學系計算數學專業理學碩士學位、西安電子科技大學雷達信號處理國家重點實驗室電路與系統專業博士學位。1990年7月至1994年9月在西電公司電子計算技術套用研究所工作,從事有限元分析程式設計、工程算法設計、計算與分析等計算套用與研究工作;1994年10月調入西安電子科技大學計算學院從事教學和科研工作至今。2004年至2005年被國家留學基金委批准選派赴加拿大University of Guelph 做訪問學者,從事生物信息學交叉學科的研究工作。在科研方面,先後主持多項國家自然科學基金,863子項目,教育部博士點學科基金,國家留學回國人員基金及多項省部級項目,科研成果獲多項省部級獎勵。在教學方面,曾榮獲校“永新”、“貝爾”、“華為”、等獎教金、“陝西省師德標兵”稱號、 西安電子科技大學“十佳師德標兵”稱號。近年來,主要研究方向包括計算生物信息學,生物數據挖掘,圖論與組合最佳化算法及套用等。

研究方向

計算生物信息學

生物網路數據分析
生物網路的模體識別
生物網路的比較與進化分析
蛋白質網路的分解及蛋白功能的預測
生物序列數據分析
生物序列的模體識別與發現
基因的發現與識別
生物網路數據分析平台及可視化軟體
網路數據分析評價平台的建立
可視化軟體的開發

數據挖掘技術及套用

圖的挖掘技術
Ø 頻繁子圖挖掘算法研究
Ø 圖的聚類算法研究
文本挖掘
Ø 基於機器學習的文本信息抽取
Ø 文本中基因和蛋白質實體的識別
智慧型化故障檢測與診斷
Ø 故障預測模型構建方法研究
Ø 粗糙集理論及屬性約簡算法研究

圖論與組合最佳化算法及套用

圖的劃分算法
Ø 圖的劃分算法研究
Ø 劃分算法的套用
組合最佳化算法
Ø 生物信息中的組合最佳化問題
Ø 智慧型化計算方法

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