生物信息學：基礎及套用

內容簡介

本書簡要介紹生物信息學的發展歷史、主要研究領域及套用前景，並重點講述生物信息學的基本知識點和基本技術、方法，生物分子信息資料庫的類型及套用，複雜疾病的生物信息學研究思路、方法和典型套用實例。每個知識單元均包括生物信息學基礎知識點、套用生物信息學的基本方法、資料庫和計算機軟體，並通過生物信息學的典型套用案例培養學生分析問題、解決問題的能力。

本書共分8章。第1章為緒論，主要介紹生物信息學發展的歷史、當前主要的研究方向及套用，尤其是在醫學研究中的套用前景。第2章介紹常用的生物信息學資料庫以及相應的數據檢索方法，重點講述核酸序列資料庫、蛋白質序列資料庫和蛋白質結構資料庫以及典型資料庫的格式和使用方法。第3章介紹核酸和蛋白質序列的比對方法及套用，著重講述雙序列比對的原理和常用工具。第4章和第5章分別介紹核酸序列分析和基因組注釋的主要內容、方法及工具。第6章和第7章則分別介紹從蛋白質序列分析其基本理化性質、結構和功能的方法及其在研究中的套用。第8章介紹生物信息學在人類複雜疾病的分子機理研究中的作用、主要方法和工具。

本書是面向醫學和生物學背景的本科生的生物信息學教材，也可供相關專業科研人員參考。

圖書目錄

第1章緒論

1．1生物信息學的產生與發展

1．2生物信息學的研究目的與研究內容

1．2．1生物信息學研究目的

1．2．2生物信息學研究內容

1．3生物信息學在醫學中的套用

1．3．1鑑定單基因疾病的關鍵致病基因

1．3．2研究人類複雜疾病的發生機理

第2章分子生物學資料庫

2．1概述

2．2核酸序列資料庫

2．2．1GenBank資料庫

2．2．2歐洲核酸檔案

2．3蛋白質序列資料庫

2．3．1PIR資料庫

2．3．2SwissProt資料庫

2．3．3UniProt資料庫

2．4蛋白質結構資料庫

2．4．1蛋白質結構資料庫PDB

2．4．2蛋白質結構分類資料庫SCOP

2．4．3蛋白質二級結構資料庫DSSP

2．5其他分子生物學資料庫

第3章序列比對

3．1序列比對基礎

3．1．1序列比對的分類

3．1．2序列的相似性

3．1．3序列比對的打分矩陣

3．1．4序列比對的空位罰分

3．2雙序列比對

3．2．1概述

3．2．2點陣法

3．2．3動態規劃法

3．2．4BLAST算法

3．3多序列比對

3．3．1概述

3．3．2SP模型

3．3．3動態規劃法

3．3．4星形比對算法

生物信息學：基礎及套用

基本介紹

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