甘肅省荒漠化與風沙災害防治國家重點實驗室是在甘肅省荒漠化防治重點實驗室的基礎上，於2010年8月獲科技部批准，依託甘肅省治沙研究所建立的省部共建國家重點實驗室培育基地。
甘肅省荒漠化與風沙災害防治重點實驗室立足甘肅河西地區，緊跟國際荒漠化防治研究前沿，針對西北荒漠區生態環境建設與社會經濟可持續發展重大科技需求，以荒漠化過程與機制、風沙災害機理與防治、荒漠植物多樣性保護與利用、內陸河流域生態安全與管理四個核心科學問題為主要研究方向，開展基礎理論與套用技術研究。
甘肅省荒漠化與風沙災害防治重點實驗室建有10個分析測試室，包括風沙環境風洞實驗室、土壤分析室、粒度分析室、有機物分析室、碳水同位素分析室、植物生理生態實驗室、分子實驗室、人工氣候室、植物組培室和遙感室；擁有各類科研儀器設備315台/套，總價值3016萬元，其中30萬元以上大型儀器設備29台/套，如風沙環境風洞、智慧型人工氣候室、氣象色譜質譜聯用儀、Li-6400光合螢光儀、二維粒子成像測速儀、碳同位素分析儀等。
甘肅省荒漠化與風沙災害防治重點實驗室堅持“開放、流動、聯合、競爭”的運行機制，先後與蘭州大學、中科院寒區旱區環境與工程研究所、中國林科院、甘肅農業大學等院所建立了長期合作關係，現已成為我國荒漠化防治領域從事科研、人才培養和學術交流的重要平台。
