環境微生物學——拓展篇
Environmental Microbiology
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本書旨在介紹環境微生物學中重要的微生物、微生物所依賴的不同環境的特性、檢測微生物及其活性的方法,還評價了微生物對人類活動的影響。三位作者是
亞利桑那大學的親密合作夥伴,在環境微生物學中的研究領域各不相同,卻又相輔相成.這些涉及領域廣泛的研究為本書闡明重要的知識點提供了大量例證。多位撰稿人的貢獻也使此書在深度和廣度上具朵促元有延續性,內容上則與當下的研究前沿基本一致。
根據國內讀者的需要,導讀版分為基礎篇和拓展篇,所配光碟包含原著全部彩圖。這本教材適用於環境微生物學專業的高年級本科生或研究生,也可以作為對這殼兵凳一領域感興趣的科學家和工程洪記師的參考書。
目錄
前言
致謝
作者
撰稿作者
第四部分 微生物的信息傳遞, 活動,以及與環境和營養循環的相互作用
14.1 引言
14.1.1 生物地球化學循環
14.1.2 蓋亞假說
14.2 碳循環
14.2.1 碳庫
14.2.2 碳的固定與能量流動
14.2.3 碳的呼吸
14.3 氮素循船朽船洪環
14.3.1 氮庫
14.3.2 固氮作用
14.3.3 銨同化(固定) 和氨化(礦化)
14.3.4 硝化作用
14.4 硫素循環
14.4.1 硫庫
14.4.2 同化硫酸鹽還原和硫素礦化
14.4.3 硫素氧化
14.4.4 硫素還原
14.5 離子循環
14.5.1 離子庫
14.5.2 土壤和沉積物中的離子
14.5.3 海洋環境中的離子
14.5.4 離子的氧化
14.5.5 離子的還原
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第15章 戶外生物地球化學循環的結果 David C.H erman and Raina M.Maier
15.1 引言
15.2 微生物參與的腐蝕作用
15.2.1 金屬腐蝕
15.3 酸性礦物排水和金屬的回收
15.3.1 酸性礦物排水
15.3.2 金屬回收
15.3.3 煤炭脫硫
15.6 地下水的硝酸鹽污染
15.7 堆肥
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第16章 微生物的信息傳遞: 細菌-細菌,細菌-宿主 Leland S.Pierson I I I,Raina M.Maier and Ian L.Pep per
16.1 引言
16.2.2
根癌土壤桿菌,一種普遍存在的植物茅去漏臘病原體的群體感應
16.2.3 群體感應和交叉干擾
16.3.1 γ-丁酸內酯
16.3.2 信號肽轉導
16.4 其他類型的信號轉導
16.4.1 自誘導因子-2/-3
16.4.2 群落信息竊聽者
16.4.3 細菌信息交流的干涉
16.4.4 跨界群從的信息交流
16.4.5 宿主和細菌間的信息交流
16.5 總結及核心摡念
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第17章 自然生態系統中的細菌群落 Raina M.Maier and Ian L.Pepper
17.1 細菌的群落
17.2 自然系統中細菌的多樣性
17.2.1 什麼是物種?
17.2.2 土壤中細菌的多樣性
17.2.3 海洋環境中細菌的多樣性
17.3 細菌群落的功能多樣性和惡劣環境駝阿仔的耐受能力
17.3.1 土壤細菌群落
17.3.2 土壤植物微生物間的相互作用
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第18章 全球環境變化與微生物導致的傳染病 Ian L.Pep per and Charles P.Gerba
18.1 環境中的人類病原微生物
18.1.1 土壤來源的土著病原菌
18.1.2 水基和空氣傳播的人類病原微生物
18.2 暴露途徑
18.2.1 我們呼吸的是什麼?
18.2.2 我們吃的是什麼?
18.2.3 我們喝的是什麼?
18.3 環境變化和致病微生物
18.3.1 全球氣候的變化和病原微生物
18.3.2 城市化和森林的濫伐
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第19章 微生物的傳播 Deborah T.Newby,Ian L.Pepper and Raina M.Maier
19.1 微生物傳播的影響因素
19.1.1 微生物的過濾
19.1.2 生理狀態
19.1.4 pH對微生物傳播的影響
19.1.5 離子強度對微生物傳播的影響
19.1.6 細胞附屬物
19.1.7 水文地質因素
19.1.8 被引入微生物的持久性和活性
19.2 DNA傳播的影響因素
19.3 新方法促進微生物的傳播
19.3.1 超微細菌
19.3.3 基因傳遞
19.4 微生物傳播研究
19.4.1 柱反應器研究
19.4.2 現場研究
19.4.3 示蹤劑
19.5 微生物傳播的模型
19.5.1 對流擴散模型
19.5.2 過濾模型
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第20章 微生物與有機污染物 Raina M.Maier
20.1 引言
20.2 環境法律
20.3 生物降解的全過程
20.4.1 遺傳潛能
20.4.2 毒性
20.4.3 生物可利用性
20.4.4 污染物結構
20.5 影響生物降解的環境因素
20.5.1 氧化還原條件
20.5.2 有機物質含量
20.5.3 氮
20.5.4 其他環境因素
20.6 有機污染物的生物降解
20.6.1 污染物的來源及類型
20.6.2 烷烴
20.7 生物修復
20.7.1 氧氣及其他氣體的加入
20.7.2 營養物質的添加
20.7.3 依次厭氧-好氧降解
20.7.4 表面活性劑的添加
20.7.5 微生物或DNA的加入
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第21章 微生物與金屬污染物 Timberley M.Roane,Christopher Rensing,Ian L.Pep per and Raina M.Maier
21.1 環境中的金屬物質
21.2 引起關注的原因
21.3 金屬元素的定義
21.3.1 必需的金屬元素
21.3.2 有毒的金屬元素
21.3.3 無毒的金屬元素和非必需的金屬元素
21.4 金屬的來源
21.4.1 人體來源
21.4.2 自然界來源
21.5 金屬溶解性,生物可利用性以及分類
21.5.1 金屬化學
21.5.2 陽離子交換能力
21.5.3 氧化還原勢
21.5.4 pH值
21.6 金屬對微生物細胞的毒害作用
21.7 微生物抗金屬性和解毒作用的機理
21.7.1 抗金屬性的一般機理
21.7.2 依賴金屬的抵抗機制
21.8 金屬微生物相互作用的研究方法
21.8.1 培養基
21.8.2 金屬總量/可溶性/生物可降解性的測定
21.9 重金屬的微生物生物轉化
21.9.1 氧化還原
21.10 重金屬污染的物理化學修復
21.11 土壤和沉積物中重金屬污染的微生物修複方法
21.12 水生系統中重金屬污染的微生物修複方法
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第六部分 水源性和食源性病原菌
參考文獻與擴展閱讀
第23章 指示微生物 Charles P.Gerba
23.1 指示劑微生物的概念
23.2.1 最大或然數(MPN)試驗
23.2.2 薄膜過濾(MF)試驗
23.2.3 存在與否(P-A)試驗
23.5 產氣莢膜梭狀菌
23.6 異養型菌的平板計數
23.7 噬菌體
23.8 其他潛在的指示微生物
23.9 指示微生物的判斷標準
23.10 微生物源示蹤
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第七部分 廢水處理與消毒
第24章 廢水處理和生物固體的再利用 Charles P.Gerba and Ian L.Pepper
24.1 廢水(污水)的性質
24.2 現代的廢水處理
24.2.1 初級處理
24.2.2 二級處理
24.2.3 三級處理
24.2.4 污水處理工藝對病原菌的去除
24.2.5 污水處理工藝對有機/無機污染物的去除
24.3 氧化池
24.4 化糞池
24.5 廢水的土地利用
24.6 濕地和水產養殖系統
24.7 污泥處理
24.7.1 穩定技術
24.7.2 污泥處理生產A級生物固體
24.8 生物固體和動物糞便的土地利用: 歷史觀點與當前展望
24.8.1 A/B級生物固體
24.9 生物固體土地利用的方法
24.10 B級生物固體中病原菌的含量
24.10.1 其他生物學方面的關注
24.10.2 生物固體中病原菌的風險
24.11 動物糞便中的病原菌
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第25章 飲用水的處理 Charles P.Gerba
25.1 水處理工序
25.2 水處理的要求
25.3 水的分配系統
25.4 在分配系統中有機碳和微生物的生長
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第26章 消毒 Charles P.Gerba
26.1 熱破壞
26.2 消毒動力學
26.3 影響消毒的因素
26.4 鹵素消毒劑
26.4.1 氯消毒劑
26.4.2 氯胺消毒劑
26.4.4 溴和碘
26.5 臭氧
26.6 重金屬離子
26.7 紫外線消毒
26.8 光滅活作用
26.9 γ-射線和高能射線
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第八部分 城市微生物
第27章 室內微生物 Charles P.Gerba and Ian L.Pepper
27.1 病原菌的來源
27.1.1 空氣
27.1.2 食物
27.1.3 水
27.2 污染物: 在疾病傳播中的作用
27.2.1 污染物中病原菌的發生
27.2.2 污染物中病原菌的持久性
27.2.3 病原菌的傳播
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第28章 微生物與
生物恐怖主義 Ian L.Pep per,Christop her Y.Choi and Charles P.Gerba
28.1 生物製劑被用作生物恐怖主義武器的憂慮
28.2 生物恐怖主義與飲用水
28.2.1 水分配系統中的實時監測
28.2.2 實時監控
28.2.3 污染物傳送機制與水質模型
28.3 生物恐怖主義與農業
28.3.2 口蹄疫
28.4 污染物的傳播機制
參考文獻與擴展閱讀
第29章 風險評估 Charles P.Gerba
29.1 風險評估的概念
29.2 風險評估的組成元素
29.3 風險評價的過程
29.3.1 危險性鑑定
29.3.2 暴露評價
29.3.3 劑量回響評價
29.3.4 風險特徵
29.4 微生物風險評價
思考題
參考文獻與擴展閱讀
索引
圖書目錄
前言
致謝
作者
撰稿作者
第四部分 微生物的信息傳遞, 活動,以及與環境和營養循環的相互作用
第五部分有機污染物與金屬污染物的治理
第六部分 水源性和食源性病原菌
第七部分 廢水處理與消毒
第八部分 城市微生物
索引
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第15章 戶外生物地球化學循環的結果 David C.H erman and Raina M.Maier
15.1 引言
15.2 微生物參與的腐蝕作用
15.2.1 金屬腐蝕
15.3 酸性礦物排水和金屬的回收
15.3.1 酸性礦物排水
15.3.2 金屬回收
15.3.3 煤炭脫硫
15.6 地下水的硝酸鹽污染
15.7 堆肥
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第16章 微生物的信息傳遞: 細菌-細菌,細菌-宿主 Leland S.Pierson I I I,Raina M.Maier and Ian L.Pep per
16.1 引言
16.2.2
根癌土壤桿菌,一種普遍存在的植物病原體的群體感應
16.2.3 群體感應和交叉干擾
16.3.1 γ-丁酸內酯
16.3.2 信號肽轉導
16.4 其他類型的信號轉導
16.4.1 自誘導因子-2/-3
16.4.2 群落信息竊聽者
16.4.3 細菌信息交流的干涉
16.4.4 跨界群從的信息交流
16.4.5 宿主和細菌間的信息交流
16.5 總結及核心摡念
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第17章 自然生態系統中的細菌群落 Raina M.Maier and Ian L.Pepper
17.1 細菌的群落
17.2 自然系統中細菌的多樣性
17.2.1 什麼是物種?
17.2.2 土壤中細菌的多樣性
17.2.3 海洋環境中細菌的多樣性
17.3 細菌群落的功能多樣性和惡劣環境的耐受能力
17.3.1 土壤細菌群落
17.3.2 土壤植物微生物間的相互作用
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第18章 全球環境變化與微生物導致的傳染病 Ian L.Pep per and Charles P.Gerba
18.1 環境中的人類病原微生物
18.1.1 土壤來源的土著病原菌
18.1.2 水基和空氣傳播的人類病原微生物
18.2 暴露途徑
18.2.1 我們呼吸的是什麼?
18.2.2 我們吃的是什麼?
18.2.3 我們喝的是什麼?
18.3 環境變化和致病微生物
18.3.1 全球氣候的變化和病原微生物
18.3.2 城市化和森林的濫伐
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第19章 微生物的傳播 Deborah T.Newby,Ian L.Pepper and Raina M.Maier
19.1 微生物傳播的影響因素
19.1.1 微生物的過濾
19.1.2 生理狀態
19.1.4 pH對微生物傳播的影響
19.1.5 離子強度對微生物傳播的影響
19.1.6 細胞附屬物
19.1.7 水文地質因素
19.1.8 被引入微生物的持久性和活性
19.2 DNA傳播的影響因素
19.3 新方法促進微生物的傳播
19.3.1 超微細菌
19.3.3 基因傳遞
19.4 微生物傳播研究
19.4.1 柱反應器研究
19.4.2 現場研究
19.4.3 示蹤劑
19.5 微生物傳播的模型
19.5.1 對流擴散模型
19.5.2 過濾模型
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第20章 微生物與有機污染物 Raina M.Maier
20.1 引言
20.2 環境法律
20.3 生物降解的全過程
20.4.1 遺傳潛能
20.4.2 毒性
20.4.3 生物可利用性
20.4.4 污染物結構
20.5 影響生物降解的環境因素
20.5.1 氧化還原條件
20.5.2 有機物質含量
20.5.3 氮
20.5.4 其他環境因素
20.6 有機污染物的生物降解
20.6.1 污染物的來源及類型
20.6.2 烷烴
20.7 生物修復
20.7.1 氧氣及其他氣體的加入
20.7.2 營養物質的添加
20.7.3 依次厭氧-好氧降解
20.7.4 表面活性劑的添加
20.7.5 微生物或DNA的加入
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第21章 微生物與金屬污染物 Timberley M.Roane,Christopher Rensing,Ian L.Pep per and Raina M.Maier
21.1 環境中的金屬物質
21.2 引起關注的原因
21.3 金屬元素的定義
21.3.1 必需的金屬元素
21.3.2 有毒的金屬元素
21.3.3 無毒的金屬元素和非必需的金屬元素
21.4 金屬的來源
21.4.1 人體來源
21.4.2 自然界來源
21.5 金屬溶解性,生物可利用性以及分類
21.5.1 金屬化學
21.5.2 陽離子交換能力
21.5.3 氧化還原勢
21.5.4 pH值
21.6 金屬對微生物細胞的毒害作用
21.7 微生物抗金屬性和解毒作用的機理
21.7.1 抗金屬性的一般機理
21.7.2 依賴金屬的抵抗機制
21.8 金屬微生物相互作用的研究方法
21.8.1 培養基
21.8.2 金屬總量/可溶性/生物可降解性的測定
21.9 重金屬的微生物生物轉化
21.9.1 氧化還原
21.10 重金屬污染的物理化學修復
21.11 土壤和沉積物中重金屬污染的微生物修複方法
21.12 水生系統中重金屬污染的微生物修複方法
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第六部分 水源性和食源性病原菌
參考文獻與擴展閱讀
第23章 指示微生物 Charles P.Gerba
23.1 指示劑微生物的概念
23.2.1 最大或然數(MPN)試驗
23.2.2 薄膜過濾(MF)試驗
23.2.3 存在與否(P-A)試驗
23.5 產氣莢膜梭狀菌
23.6 異養型菌的平板計數
23.7 噬菌體
23.8 其他潛在的指示微生物
23.9 指示微生物的判斷標準
23.10 微生物源示蹤
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第七部分 廢水處理與消毒
第24章 廢水處理和生物固體的再利用 Charles P.Gerba and Ian L.Pepper
24.1 廢水(污水)的性質
24.2 現代的廢水處理
24.2.1 初級處理
24.2.2 二級處理
24.2.3 三級處理
24.2.4 污水處理工藝對病原菌的去除
24.2.5 污水處理工藝對有機/無機污染物的去除
24.3 氧化池
24.4 化糞池
24.5 廢水的土地利用
24.6 濕地和水產養殖系統
24.7 污泥處理
24.7.1 穩定技術
24.7.2 污泥處理生產A級生物固體
24.8 生物固體和動物糞便的土地利用: 歷史觀點與當前展望
24.8.1 A/B級生物固體
24.9 生物固體土地利用的方法
24.10 B級生物固體中病原菌的含量
24.10.1 其他生物學方面的關注
24.10.2 生物固體中病原菌的風險
24.11 動物糞便中的病原菌
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第25章 飲用水的處理 Charles P.Gerba
25.1 水處理工序
25.2 水處理的要求
25.3 水的分配系統
25.4 在分配系統中有機碳和微生物的生長
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第26章 消毒 Charles P.Gerba
26.1 熱破壞
26.2 消毒動力學
26.3 影響消毒的因素
26.4 鹵素消毒劑
26.4.1 氯消毒劑
26.4.2 氯胺消毒劑
26.4.4 溴和碘
26.5 臭氧
26.6 重金屬離子
26.7 紫外線消毒
26.8 光滅活作用
26.9 γ-射線和高能射線
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第八部分 城市微生物
第27章 室內微生物 Charles P.Gerba and Ian L.Pepper
27.1 病原菌的來源
27.1.1 空氣
27.1.2 食物
27.1.3 水
27.2 污染物: 在疾病傳播中的作用
27.2.1 污染物中病原菌的發生
27.2.2 污染物中病原菌的持久性
27.2.3 病原菌的傳播
思考題
參考文獻與擴展閱讀
第28章 微生物與
生物恐怖主義 Ian L.Pep per,Christop her Y.Choi and Charles P.Gerba
28.1 生物製劑被用作生物恐怖主義武器的憂慮
28.2 生物恐怖主義與飲用水
28.2.1 水分配系統中的實時監測
28.2.2 實時監控
28.2.3 污染物傳送機制與水質模型
28.3 生物恐怖主義與農業
28.3.2 口蹄疫
28.4 污染物的傳播機制
參考文獻與擴展閱讀
第29章 風險評估 Charles P.Gerba
29.1 風險評估的概念
29.2 風險評估的組成元素
29.3 風險評價的過程
29.3.1 危險性鑑定
29.3.2 暴露評價
29.3.3 劑量回響評價
29.3.4 風險特徵
29.4 微生物風險評價
思考題
參考文獻與擴展閱讀
索引
圖書目錄
前言
致謝
作者
撰稿作者
第四部分 微生物的信息傳遞, 活動,以及與環境和營養循環的相互作用
第五部分有機污染物與金屬污染物的治理
第六部分 水源性和食源性病原菌
第七部分 廢水處理與消毒
第八部分 城市微生物
索引