總體線路
軌道1號線
東西方向的骨幹線路,全長46.5公里,由湖州站出發向東,沿西塞山路、紅旗路、北街、苕溪東路、吳興大道、大港路、年豐路走線,終於南潯虹陽路,另布局南潯站支線。貫穿城市東西向發展主軸,直連城市主副中妹汽禁心,串聯南太湖新區、湖州老城、東部新城、織里與南潯,沿線客流集散點主要包括湖州站、南街商業中心、吳興區政府、南潯古鎮、南潯站等。
軌道2號線
南北方向的骨幹線路,全長25.2公堡她組裡,由圖影濕地站向南,沿洪圖線、太湖路、同心路、長興路、仁皇山路、青銅路、南街、二環南路走線,少盼記宙終於長西村站。貫穿城市南北向發展主軸,覆蓋服務南太湖新區、湖州老城、龍之夢旅遊區等,緩解南北向交通壓力,引導城市南北向發展,沿線客流集散點主要包括南郊風景區、南街商業中心、市政府、奧體中心、太湖度假區、龍之夢旅遊區等。
軌道3號線
城市切向加密線路,全長28.1公里,由龍之夢南門站出發向東,沿弁山大道、環太湖路、湖山大道、中興大道、區府路走線,終於湖州東站。線路重點覆蓋城市東部、北部發展新區地帶,串聯並帶動圖影板塊、長東板塊、市北板塊、東部新城片區等潛力地區發展,沿線客流集散點主要包括龍之夢旅遊區、太湖度假區、市北總設轎部花園、吳興區政府、湖州東站等。
軌道4號線
湖長協調發展支撐線路,全長45.2公里,由長興站出發向西,沿發展大道、陳王路、中央大道、金陵路、雉州大地照譽道、G104、三環北路、二環東路走線,終於二里橋路站,同時預留湖州站支線。線路重點覆蓋服務仁皇山板塊、市北板塊及老城片區東部,並覆蓋長興主城的發展主軸,沿線客流集散點主要包括長興站、長興南站、長興汽車總站、長興縣政府、湖州站、市政府、中心醫院、湖州師範學院等。
此外,還有南通至蘇州至湖州城際鐵路,水鄉旅遊線:起點上海青浦,途經江蘇吳燥永櫻江,湖州南潯,終點桐鄉鹽官古城,湖州至嘉興城際,湖州至德清市域鐵路,漏熱連蒸湖州至安吉市域鐵路,安吉至德清市域鐵路,爭取納入國家發改委正在編制的《長三角地區多層次軌道交通體系規劃》和浙江省發改委正在編制的《浙江省中長期軌道交通發展規劃(2021-2025年)》。