淹水土壤是指處於間歇性或長期被水層覆蓋下的土壤。濕地土壤和一些非濕地土壤通常在洪澇、灌水或強降雨條件下處於淹水狀態。淹水土壤具有一些特殊性質，尤其是滯水性和潛育性。土壤學中，淹水土壤主要指人為水稻土。水稻土的形成過程就是水耕熟化過程。土壤種稻以後進行季節性淹水，改變了土壤的水熱狀況，出現土壤氧化還原交替過程和相應的物質轉移，又由於施用肥料，導致土壤的復鹽基作用。
因此，水稻土與原有土壤（不包括沼澤土）相比，其有機質含量增加，表層尤為明顯，形成鬆軟的耕作熟化層；土壤中交換性鹽基將重新分布，在飽和的土壤中鹽基淋溶，而在非飽和的土壤中發生復鹽基作用；在淹水條件下，游離的氧化鐵、氧化錳被還原為低價鐵、錳化合物，這些低價鐵、錳化合物淋溶下移，使耕作層的鐵錳含量不斷減少，並氧化澱積於土壤下層。於是耕作層土色逐漸脫離母質的影響，而向灰色、淺灰色甚至灰白色發展；而澱積於下層的鐵錳氧化物.出現黃棕、紅棕色銹斑銹紋或暗棕、黑棕色鐵錳斑塊和結核；水稻土中的黏粒、細粉砂粒等物質在水的重力作用下，沿著土壤孔隙做垂直運動，造成水稻土黏粒下移，心土層比較黏重，特別是形成一層比旱作土更加明顯的犁底層。這些物質還會向表面或側面移動，導致水稻土出現淀漿板結層。
