採用浸入法將蛋白質從凝膠轉移至硝酸纖維素膜是先將凝膠緊貼於一塊硝酸纖維素膜，然後再將這種夾層組合浸入盛有大量緩衝液的轉印槽內，使電流從轉印槽的一側通向另一側(Towbinetal．1979)。通過電洗脫的方法可將蛋白質從凝膠中轉印至濾膜上，如同在凝膠中遷移，只不過移動方向與膠平面垂直。若操作仔細，這是一種可將許多蛋白質轉印至膜上非常有效的方法。此法比半乾法稍微費時，也需用較多的緩衝液，但它更為簡便。
