江西省科學院流域生態研究所（江西省科學院鄱陽湖研究中心）坐落於風景秀麗的南昌市艾溪湖畔，自2010年6月成立以來，圍繞鄱陽湖流域生態環境健康與安全的關鍵共性問題開展創新研究，著力解決制約江西社會經濟發展的流域資源環境最佳化配置、環境污染治理與生態修復的基礎理論與套用技術瓶頸，主要研究內容包括：流域生態環境健康診斷與評估、流域污染治理與生態修復，研究所（中心）承擔國家自然科學基金等省部級以上科研項目10餘項，發表SCI/EI學術論文20餘篇，獲國家專利授權20餘項，取得了一些有特色的成果。研究所在職職工包括正高3人、副高3人、中級5人，具有博士學位10人；學科涉及生態學、環境科學、地理學、土壤學、濕地科學等。
