食品與營養工程學院是江蘇食品職業技術學院內設的二級學院。現開設食品加工技術、食品藥品監督管理、食品營養與檢測、食品貯運與行銷、食品生物技術、飼料與動物營養、動物科學與技術等七個專業,其中,食品加工技術、食品營養與檢測專業分別於2006、2008年被省教育廳評為江蘇省高等學校特色專業建設點。
食品與營養工程學院師資隊伍結構合理、專業思想活躍,創新意識強,是一支以高學歷、高職稱、雙師型為主體的教師隊伍。學院現有在編專任教師61人,其中教授8人,副教授12人、講師42人,具有碩士以上學位56人,其中博士5人。有江蘇省高等學校教學名師1人,教育部高職高專食品類專業教學指導委員會主任1人,江蘇省職業技能鑑定專家委員會委員2人,淮安市“十百千”人才培養對象5人,江蘇省“333”工程培養對象2人,江蘇省高校“青藍工程”優秀青年骨幹教師培養對象3人。食品加工技術教學團隊於2008年被評為江蘇省高等學校優秀教學團隊。