水稻基因索引資料庫

2023年4月，華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組發表最新研究成果，建成世界上首個基於同源基因的水稻泛基因組綜合資料庫——水稻基因索引資料庫。

基本介紹

• 中文名：水稻基因索引資料庫
• 發表時間：2023年4月

詳細介紹

在資料庫里，亞洲稻的每一個基因都能輕鬆找到同源或相近的基因，以及追蹤其演變歷史。目前，資料庫儲存於華中農業大學，向全球開放免費使用。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食。據記載，全球共有多達78萬份水稻種質材料，其中國際水稻研究所種質資源庫里收藏的亞洲稻種質及其野生近緣種就達13萬多份。張建偉教授課題組所建成的水稻基因索引資料庫，是從13萬多份亞洲稻種質中選取具有遺傳多樣性代表的3000份核心種植資源，再從3000份中選取最具代表性的16份，完成全基因組測序及基因注釋，作為其基本數據信息。

建設意義

該平台能為用戶提供豐富的模組和工具，方便研究人員對不同種質基因以及基因同源關係進行查詢、分析和可視化，為全球水稻研究學者提供免費線上檢索和分析服務。研究人員可以通過關鍵字、序列、同源關係等3種方式在資料庫中進行搜尋，並在微觀和巨觀尺度對種質間基因組共線性進行分析和可視化研究。