人物經歷
1998年7月於
華南理工大學獲得博士學位,1998年7月至2000年7月在
華東理工大學生物工程學院生物反應器國家重點實驗室從事博士後研究。2000年7月至今在
上海交通大學生命科學技術學院工作。2005年12月被聘為教授;2006年被聘為博士生導師。2007年12月至2008年12月美國加州大學聖地亞哥分校(UCSD)斯克林普斯海洋研究所(Scripps Institution of Oceanography )海洋生物技術與生物醫藥中心訪問學者。任
中國生物化學與分子生物學會海洋生化與分子生物學分會常務理事,
中國微生物學會海洋微生物專業委員會委員,中華醫學會航海醫學分會海洋生物工程專業委員會委員,中華醫學會航海醫學分會海洋微生物與分子生物學專業委員會委員,上海市微生物學會海洋微生物專業委員會(籌)副主任委員,上海市藥學會海洋藥物專業委員會委員。國際期刊Prime Journal of Microbiology Research編輯,Blue Biotechnology Journal(USA,海洋生物技術雜誌)編委。
研究方向
全面系統研究海綿、珊瑚共生微生物。具體方向如下:
1.海洋共生
微生物製藥:從海綿、珊瑚中分離共生微生物進行代謝產物研究;利用發酵工程、代謝工程、
基因工程等技術大量製備具有套用價值的代謝產物;進行代謝產物的生物合成機制研究。
2.海洋共生微生物結構與功能:採用微生物學、
分子生物學、現代組學、比較基因組學等技術揭示海綿、珊瑚共生微生物的群落組成與空間分布;研究海綿、珊瑚共生微生物的代謝潛力與功能,以及宿主與共生微生物間相互關係與協同進化。
3.海洋共生微生物環境組學:研究海綿、珊瑚共生微生物在海洋生態系統的物質與能量循環中的作用;從基因、轉錄、表達三個層次研究海綿、珊瑚共生微生物與海洋環境變化的關係及適應機制。
主要貢獻
近年來以第一作者或通訊作者在國際知名SCI期刊Bioresource Technology、Marine Biotechnology、Microbial Ecology、Marine Drugs、Process Biochemistry、Journal of Experimental Marine Biology and Ecology、Journal of Applied Microbiology等發表論文25篇(其中中科院I─II區論文13篇)。已授權專利7項,公開專利6項。創建並主講國家級精品課程“
細胞工程”。已主編出版高校教材6部,其中2部為國家“十一五”規劃教材。
發表論文
1. Han, M.,He, L., Lin, H., Li, Z.* Bacterial and archaeal symbionts in the South China Sea sponge Phakellia fusca: Community structure, relative abundance, and ammonia-oxidizing populations.Marine Biotechnology (SCI). 2012,doi:10.1007/s10126-012-9436-5.online。
2. Yin, Y., Gao, Q., Zhang, F., Li, Z.* Medium optimization for the high yield production of single (+)-terrein by Aspergillus terreus strain PF26 derived from marine sponge Phakellia fusca. Process Biochemistry (SCI). 2012,doi:10.1016/j.procbio.2012.02.005.online。
3. Jin, L.J., Ma, W., Peng, C.S,, Yin, Y., Xu, B.L., Zhang, F.L., Guo, Y.W., Li, Z.Y*.Bacillamide C production by the optimized cultivation of the Bacillus atrophaeus strain C89 associated with the South China Sea sponge Dysidea avara. Process Biochemistry (SCI). 2011,46:1153-1159。
4. Ding, B., Yin, Y., Zhang, F.L., Li, Z.Y.* Recovery and phylogenetic diversity of culturable fungi associated with marine sponges Clathrina luteoculcitella and Holoxea sp. in the South China Sea. Marine Biotechnology (SCI). 2011,13:713-721。
5. Zhou, K., Zhang, X., Zhang, F.L., Li , Z.Y*. Phylogenetically diverse cultivable fungal community and polyketide synthase (PKS), non-ribosomal peptide synthase (NRPS) genes associated with the South China Sea sponges. Microbial Ecology (SCI). 2011,62:644-654。
6. Huang, X., Xeu, D., Peng, C., Zhang, F.,Li, Z*., Guo, Y*.Streptomycindole,a new indole alkaloid from a marine actinomycete associated with sponge Craniella australiensis. Helvetica Chimica Acta (SCI). 2011,94:1838-1842。
7. Liu, F., Han, M.Q., Zhang, F.L., Li, Z.Y. * Distribution and abundance of archaea in South China Sea sponge Holoxea sp. and the presence of ammonia-oxidizing archaea in sponge cells. Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine (SCI). 2011,doi:10.1155/2011/723696。
8. Chu, D., Peng, C.S., Ding, B., Liu, F., Zhang, F.L., Lin, H.W., Li, Z.Y. * Biological active metabolite cyclo (L-Trp-L-Phe) produced by South China Sea sponge Holoxea sp. associated fungus Aspergillus versicolor strain TS08. Bioprocess and Biosystems Engineering (SCI). 2011,34: 223-229。
9. Gao, Y., Yu, L.L., Peng, C.S., Li, Z.Y.,* Guo, Y.W.* Diketopiperazines from two strains of South China Sea sponge-associated microorganisms. Biochemical Systematics and Ecology (SCI). 2010,38:931-934。
10. Li, Z.* Advances in marine microbial symbionts in the China Sea and related pharmaceutical metabolites. Marine Drugs (SCI). 2009,7:113-129。
11. Han, Y., Yang,B.J., Zhang, F.L., Miao, X.L., Li, Z.Y.* Characterization of antifungal chitinase from marine Streptomyces sp. DA11 associated with South China Sea sponge Craniella australiensis. Marine Biotechnology (SCI). 2009,11:132-140。
12. Zhang, W., Li, Z.Y.*, Miao, X.L., Zhang, F.L. The screening of antimicrobial bacteria with diverse novel nonribosomal peptide synthetase (NRPS) genes from South China Sea sponges. Marine Biotechnology (SCI). 2009,11:346-355。
13. Zhang, W., Zhang, F.L., Li,Z.Y.*, Miao,X.L., Meng, Q.P., Zhang, X.S. Investigation of sponge-associated cultivable bacteria with polyketide synthase genes and antimicrobial activity in the South China Sea. Journal of Applied Microbiology (SCI). 2009,107:567-575。
14. Yu, L.L., Li, Z.Y., Peng, C.S., Li, Z.Y.*, Guo,Y.W.* Neobacillamide A, a novel thiazole-containing alkaloid from the marine bacterium Bacillus vaiismortis C89, associated with South China Sea sponge Dysidea avara. Helvetica Chimica Acta (SCI). 2009,92:607-612。
15. Zhang, H., Zhang, F., Li, Z.Y.* Gene analysis, optimized production and property of marine lipase from Bacillus pumilus B106 associated with South China Sea sponge Halichondria rugosa. World Journal of Microbiology & biotechnology (SCI). 2009,25:1267-1274。
16. Han, Y., Li, Z.Y.*, Miao, X.L., Zhang, F.L. Statistical optimization of medium components to improve the chitinase activity of Streptomyces sp. DA11 associated with the South China Sea sponge Craniella australiensis. Process Biochemistry (SCI). 2008,43:1088-1093。
17. Li, Z.Y.*, Peng, C.S., Shen,Y., Miao, X.L., Zhang, H.J., Lin, H.W. L,L-diketopiperazines from Alcaligens feacalis A72 associated with South China Sea sponge Stelletta tenuis. Biochemical Systematics and Ecology (SCI). 2008,36:230-234。
18. Li, Z.Y.*, He, L.M., Miao, X.L. Cultivable bacterial community from South China Sea sponge as revealed by DGGE fingerprinting and 16S rDNA phylogenetic analysis. Current Microbiology (SCI). 2007,55:465-472。
19. Li, Z.Y.*, Hu, Y., Liu, Y., Huang, Y., He, L.M., Miao, X.L. 16S rDNA clone library based bacterial phylogenetic diversity associated with three South China Sea sponges. World Journal of Microbiology & Biotechnology (SCI). 2007,23:1265-1272。
20. Li, Z.Y.*, Hu, Y., Huang, Y.Q., Huang, Y. Isolation and phylogenetic analysis of the biologically active bacteria associated with three South China Sea sponges. Microbiology (SCI). 2007,76:494-499。
21. Li, Z.Y.*, Guo, S.Y., Li, L., Cai, M.Y. Effect of magnetic field on the growth and nutrition composition of Spirulina platensis. Bioresource Technology (SCI). 2007, 98: 700-705。
22. Li, Z.Y.*, He, L.M. Wu, J., Jiang, Q. Bacterial community diversity associated with four marine sponges from the South China Sea based on 16S rDNA-DGGE fingerprinting. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology (SCI). 2006,329:75-85。
23. Li, Z.Y.*, Liu,Y. Marine sponge Craniella austrialiensis-associated bacterial diversity revelation based on 16S rDNA library and biologically active actinomycetes screening,phylogenetic analysis. Letters in Applied Microbiology (SCI). 2006,43: 410-416。
24. Li, Z.Y.*, Guo, S.Y., Li, L. Study on the process,thermodynamical isotherm and mechanism of Cr(III) biosorption by Spirulina platensis. Journal of Food Engineering (SCI). 2006, 75: 129-136。
25. Li,Z.Y.*,Guo,S.Y.,Li,L. Bioeffects of selenite on the growth of Spirulina platensis and its bio-transformation. Bioresource Technology (SCI).2003, 89:171-176。
26. Li, Z.Y*. Advances in marine symbiontic cyanobacteria. In: Gault , P.M. and Marler, H.J. (eds). Handbook on Cyanobacteria: Biochemistry, Biotechnology and Applications. Nova Science Publishers, New York. 2009,pp.463-472.(ISBN: 978-1-61668-300-9)。
27. Li, Z.Y.* Application of PCR-DGGE fingerprinting in molecular ecology of marine microbial symbionts. In: Ovesen, K. and Matthiesen, U.(eds).DNA: Fingerprinting, Sequencing and Chips. Nova Science Publishers, New York. 2009,pp.221-229. (ISBN: 978-1-60741-814-6)。
研究成果
近年來主持的研究課題:
(1)國家自然基金項目“利用深度測序與比較元基因組學分析海綿共生微生物群落代謝潛力與生態學功能(2012-2015,主持)”。
(2)國家自然基金項目“海綿共生古菌、細菌的氮循環
生態學功能的分子證據”(2011-2013,主持)”。
(3)國家863計畫“海洋功能天然產物規模化製備與利用評價技術”子課題“海綿共生微生物藥源化合物大規模發酵製備工藝與調控技術”(2011-2013,子課題負責)
(4)國家863計畫“海洋共生微生物資源的開發與利用”(2007-2010,李志勇主持)。
(5)國家863計畫“海綿共生細菌種群結構分子診斷技術的建立”(2002-2004,I期;2004-2005,II期滾動資助;主持)。
(6)教育部新世紀優秀人才計畫“基於宏基因組的海綿及其共生微生物功能基因研究”(2007-2009,主持)。
(7)上海市科技啟明星人才計畫“海綿活性菌混合培養協同增強生物活性的基礎技術研究”(2004-2007,主持)。
(8)上海高校優秀青年教師後備人選課題“南海海綿活性菌生物篩選、發酵培養與分類學研究”(2003-2006,主持)。
(9)國家自然基金委創新群體項目子課題“南海貪婪掘海綿共附生Bacillus vallismortis生物合成Neobacillamise A的分子機理研究”(2008-2010,子課題負責)。
(10)上海市科委“登山行動計畫”重大課題子課題“產毒赤潮藻現場快速的分子檢測技術初探”(2006-2008, 子課題負責)。
獲獎記錄
教育部新世紀優秀人才(2006),上海市青年科技啟明星(2004),上海市高校優秀青年教師(2008)。
2部教材獲上海市高校優秀教材一等、二等獎。