有根樹

有根樹是具有方向的系統發生樹(phylogenetic tree)，包含唯一的節點，將其作為樹中所有物種的最近共同祖先。最常用的確定樹根的方法是使用一個或多個無可爭議的同源物種作為外群(outgroup)，這個外群要足夠近，以提供足夠的信息，但又不能太近以至於和樹中的種類相混。