新藥模擬計算平台是一種用於藥學領域的工藝試驗儀器,於2010年11月3日啟用。
基本介紹
- 中文名:新藥模擬計算平台
- 產地:美國
- 學科領域:藥學
- 啟用日期:2010年11月3日
- 所屬類別:工藝試驗儀器 > 電子工藝實驗設備
新藥模擬計算平台是一種用於藥學領域的工藝試驗儀器,於2010年11月3日啟用。
新藥模擬計算平台是一種用於藥學領域的工藝試驗儀器,於2010年11月3日啟用。技術指標高篩選速度,低假陽性。1主要功能活性化合物的虛擬篩選,並從篩選的活性化合物出發進行靶點的發現與確證。可以利用分子動力學模擬方法進行蛋白...
國家氣象中心利用“神威”計算機精確地完成了極為複雜的中尺度數值天氣預報,在國慶五十周年和澳門回歸等重大活動的氣象保障中發揮了關鍵作用;中科院上海藥物研究所用“神威”計算機作為通用的藥物研究平台,大大縮短了新藥的研製周期。中科院大氣物理研究所用“神威”機進行新一代高解析度全球大氣模式動力框架的並行計算,...
國家級超級計算濟南中心 “神威藍光”選址位於濟南高新區服務產業聚集區,該系統峰值速度超過每秒千萬億次浮點運算、存儲容量達到PB級,系統建成後將是集高性能計算、存儲和顯示環境為一體的超級計算平台。該項目計畫由國家科技部投入2億元,省府配套投入4億元資金建設而成。國產CPU 神威1600 在中國的3台千萬億次超級...
《計算機輔助模擬有機化合物及藥物ADMET性質的研究》是依託北京化工大學,由閻愛俠擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 計算機輔助藥物設計對於開發擁有自主智慧財產權的新藥具有及其重要的理論和實際意義。藥物的ADMET 性質包括藥物的吸收、分布、代謝、排泄和毒性等性質,是藥物設計中一個很重要的研究領域。本項目...
OPTIMUS是指過程集成和最佳化設計軟體,集成CAD/CAE仿真工具,實現仿真流程自動化,包括試驗設計、單目標/多目標最佳化、魯棒性/可靠性設計等模組,是多學科仿真設計輔助工具。OPTIMUS——優秀的過程集成與最佳化設計平台 當今,許多公司在進行產品設計時,都採用軟體工具來代替傳統的實驗,並且公認數值模擬比實驗不僅要快的多,...
3有關理論計算、技術和設備/95 3.1常用的計算類型96 3.1.1勢能面96 3.1.2單點能97 3.1.3幾何最佳化97 3.1.4分子性質計算98 3.1.5構象分析101 3.2理論計算基礎104 3.2.1量子化學105 3.2.2分子力學110 3.2.3量子力學與分子力學相結合的方法(QM/MM)113 3.2.4分子動力學模擬方法115 3.2.5...
香港中文大學(深圳)科比爾卡創新藥物開發研究院的重點研究領域集中在新藥開發上,研究方向主要包括藥物受體結構生物學研究、藥物計算化學研究、功能藥物分子的有機合成和藥物化學的研究、受體功能藥物分子的功能藥理學等。通過X射線單晶衍射、核磁共振和電子顯微學等方法進行藥物受體結構生物學研究,藉助計算機輔助和分子模擬...
研究內容包括:基於國內外最新的實驗觀察研究成果,建立能描述聚合物封裝類藥物在特定生理環境下的膨脹、擴散、分解等多物理耦合過程的三維連續數學模型;通過分子模擬方法計算得到包括擴散係數、膨脹/擴散/分解臨界濃度在內的一些關鍵參數;提出求解連續模型的有限元數值方法並實施,包括處理移動邊界條件,得到藥物釋放隨時間...
國際“象棋高手”“深藍”、日本的“地球模擬器”都屬於這樣的超級計算機,很多超級計算機是非專用系統,服務于軍事、醫藥、氣象、金融、能源、環境和製造業等眾多領域。發展背景 超級計算機是1929年《紐約世界報》中最先報導出的一個名詞,它是將大量的處理器集中在一起以處理龐大的數據量,同時運算速度比常規計算...
2020年7月,中國科大在“神威·太湖之光”上首次實現千萬核心並行第一性原理計算模擬。2022年,中國的神威·太湖之光全球超級計算機500強排名位列前十。研發背景 超級計算機,被稱為“國之重器”,超級計算屬於戰略高技術領域,是世界各國競相角逐的科技制高點,也是一個國家科技實力的重要標誌之一。神威·太湖之光超...
認知計算的一個目標是讓計算機系統能夠像人的大腦一樣學習、思考,並做出正確的決策。人腦與電腦各有所長,認知計算系統可以成為一個很好的輔助性工具,配合人類進行工作,解決人腦所不擅長解決的一些問題。認知計算源自模擬人腦的計算機系統的人工智慧,90年代後,研究人員開始用認知計算一詞,以表明該學科用於教計算機...
科研人員可以在一個統一的平台上完成從基因到先導化合物設計的一系列工作,並且可以通過web形式共享研究成果。DS目前的主要功能包括:蛋白質的表征(包括蛋白-蛋白相互作用)、同源建模、分子力學計算和分子動力學模擬、基於結構藥物設計工具(包括配體-蛋白質相互作用、全新藥物設計和分子對接)、基於小分子的藥物設計工具...
為了符合模擬程式的需要, LigPrep提供的特殊設定可最佳化輸出結構。PrimeX:蛋白質X-ray晶體結構精修。包括正確放置配體,Loop區構建以及模擬退火功能。Jaguar: 快速的第一原理電子結構計算軟體包, 可以將量子化學的精確性引入生命科學研究。 Schrödinger分為windows和Linux版,方便各種平台的用戶使用。
AMBER是一款分子動力學模擬程式,全世界在學術界與製藥企業中有超過60,000名研究人員使用該程式來加速新藥的探索工作。 在金融市場,Numerix以及CompatibL針對一款全新的對手風險應用程式發布了CUDA支持並取得了18倍速度提升。Numerix為近400家金融機構所廣泛使用。 CUDA的廣泛套用造就了GPU計算專用Tesla GPU的崛起。全球...
CUDA的SDK中的編譯器和開發平台支持Windows、Linux系統,可以與Visual Studio2005集成在一起。Geforce8CUDA(Compute Unified Device Architecture)是一個新的基礎架構,這個架構可以使用GPU來解決商業、工業以及科學方面的複雜計算問題。它是一個完整的GPGPU解決方案,提供了硬體的直接訪問接口,而不必像傳統方式一樣必須...
徐志建,中國科學院上海藥物研究所研究員,國家優青(醫學部)。現任中國化學會計算(機)化學專業委員會委員、中國化學會高級會員、中國藥學會高級會員、美國化學會會員、中國計算機學會會員。主要從事分子模擬及藥物設計方面的研究工作,專注於分子模擬與藥物設計新方法的發展,以及這些方法在藥物發現方面的套用研究。 ...
作為“AI+藥物遞送”領域的領軍企業,劑泰醫藥在缺乏開源數據集及遞送相關算法的情況下,從0開始,創新研發了可電離脂質生成和設計以及LNP納米材料設計和模擬的開創性人工智慧和計算模擬算法,結合世界領先的高通量實驗技術和動物驗證平台,建立了自己的數據和算法壁壘。劑泰醫藥由美國工程院院士陳紅敏以及MIT頂尖科學家...
量易伏(Quantum Leaf)是百度研究院旗下量子計算研究所開發的雲原生(Cloud Native)量子計算平台。量易伏很好地實現了量子計算和雲計算的深度融合,是一把開啟量子時代大門的鑰匙。用戶可以在量易伏上編程,並選擇在量子模擬器或量子計算機上運行量子程式。在“百度世界大會2020”上,百度量子計算研究所推出了百度量子平台...
FightAIDS@Home 已由Olson實驗室獨立運作了兩年半,現在加入World Community Grid計算平台,一個以運作人類公益的項目作為使命的公總計算格線。當前 FightAIDS@Home客戶端是從Entropia繼承的,但未能同時兼顧到 FightAIDS@Home成員和Olson實驗室。有幾個特性未能從 Entropia 環境帶到這個項目,而且新版本的AutoDock代碼不能...
以創新藥物先導結構的發現與最佳化為主要研究目標,開展相應的計算方法發展及套用研究,主要研究領域包括藥物發現與設計方法學、計算化學與生物學、化學與生物信息學、針對重要疾病靶標的藥物發現及設計、ADME/T預測方法等。DDDC的計算模擬技術平台功能豐富,可開展包括大規模分子對接篩選、分子動力學模擬、量子化學計算、化合...
前者通過對已知具有相同作用機理的化合物進行定量構效關係研究,繪製出藥物的藥效團模型,依照模型對化合物資料庫進行搜尋,這種篩選技術本質上是一種資料庫搜尋技術;後者主要套用分子對接技術,實施這種篩選需要獲知藥物作用靶標的分子結構,通過分子模擬手段計算化合物庫中的小分子與靶標結合的能力,預測候選化合物的...
通過理論計算和實踐經驗設計最佳化兩親性前藥結構(涉及小分子疏水或親水藥物、大分子藥物如siRNA、microRNA、多肽);用計算機化學原理和分子動力學軟體建模,模擬分子自組裝過程;採用有機化學技術合成前藥,用納米技術製備自組裝體;考察自組裝體和細胞膜、蛋白、細胞、組織、動物的相互作用,並在工作站計算平台上模擬。
治療型疫苗的設計主要依靠模擬病原分子,並通過模擬計算病原分子與免疫系統受體分子的相互作用,對疫苗進行相關位點的改進,以打破病原分子逃避免疫系統的機制,產生強烈的免疫反應而清除病原。由於疫苗分子與病原分子在結構上有較高的相似性,因此疫苗分子對機體產生的毒性應該與病原分子相當,採用這種治療方案不會因為產生...
GO Fight Against Malaria Project(對抗瘧疾)項目於2011年11月16日啟動,其任務在於尋找可能的藥物,以進一步開發出可以治療具抗藥性瘧疾的新藥。該項目藉由World Community Grid強大的計算能力來分析模擬數百萬個可能的化學物質與目標蛋白質分子間的互相作用,並預測它們減輕瘧疾症狀的能力,所篩選出來的最佳分子物質將會...
藥物的體內過程一般包括吸收、分布、代謝(生物轉化)和排泄過程。為了定量地研究藥物在上述過程中的變化情況,用數學方法模擬藥物體內過程而建立起來的數學模型,稱為藥物動力學模型。藥物在體內的轉運可看成是藥物在隔室間的轉運,這種理論稱為隔室模型理論。隔室的概念比較抽象,無生理學和解剖學的意義。但隔室的...
原料藥進行加速試驗與長期試驗所用包裝應採用模擬小桶,但所用材料與封裝條件應與大桶一致。(四)關於有效期確定的統計分析方法 一般選擇可以定量的指標進行處理,通常根據藥物含量變化計算,按照長期試驗測定數值,以標示量(%)對時間進行直線回歸,得回歸方程,求出各時間點標示量的計算值(y),然後計算標示量(y)95%...
基地現擁有一批特色儀器設備,如:核磁共振成像儀、核磁共振譜儀、環境風洞、飛行時間質譜、離子注入設備、輻照育種設備、放射滅菌設備、加速器及質子螢光分析、眼動儀、腦電儀、環境模擬廳、高性能科學計算平台、虛擬現實實驗平台、天文台、晶體材料生長設備、X光透鏡等各具特色的設備或平台,可以為相應的企業和機構提供...