《擁擠環境中蛋白質聚合的物理機制》是依託南京大學,由秦猛擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:擁擠環境中蛋白質聚合的物理機制
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:秦猛
- 依託單位:南京大學
《擁擠環境中蛋白質聚合的物理機制》是依託南京大學,由秦猛擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《擁擠環境中蛋白質聚合的物理機制》是依託南京大學,由秦猛擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要構建與真實細胞中相似的擁擠環境,通過實驗研究並輔以模擬計算,研究beta乳球蛋白的二聚化與澱粉狀纖維化聚集過程。主要包括:...
聚集過程中具有細胞毒性的中間體的形成和積累會受到熱力學和動力學機制的綜合影響。理論上,聚集體的形成過程主要存在兩種基本的動力學模型:成核依賴的聚集模型和等鏈聚集模型,而成核依賴的動力學機制與疾病密切相關。本項目通過選擇經典模型蛋白和與疾病相關的蛋白,採用生物物理和生物化學研究手段,取得了以下成果:(...
《大分子擁擠環境中蛋白質相互作用的機制》是依託武漢大學,由梁毅擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 在體內任何一種大分子都處於一個充滿其他大分子的擁擠環境中,因此迫切需要在研究體系中加入細胞內相應濃度的擁擠試劑以模擬細胞內大分子擁擠環境。生物分子間相互作用是生命現象發生的基礎。生物分子相互作用形成穩定的...
蛋白質聚集 蛋白質聚集(protein aggregation )是2018年公布的生物物理學名詞。定義 錯摺疊的蛋白質分子間通過疏水作用形成非晶態聚合物的過程。出處 《生物物理學名詞》第二版。
而理論上由於缺乏一個描述硫鍵形成和斷裂的模型,很少研究涉及含有二硫鍵的蛋白質。本項目擬構建一個包含二硫鍵形成和打開的理論模型,運用簡化的分子動力學模擬方法,研究BPTI等幾個典型含有硫鍵蛋白質的氧化摺疊過程,探索其摺疊和聚合過程的動力學和物理機制。同時,本項目還在實驗上利用紫外光照辦法研究在生理環境...
而各種直徑的碳納米管都具有優良的結構穩定性和物理化學性質,更重要的是某些尺寸的納米管結構其外在形狀和天然伴侶分子的模腔-調控蛋白質聚集的主要功能區具有驚人的相似性。因此本課題擬用碳納米管作為人工伴侶分子來探討如何防止蛋白質的聚集、伴護的機理、環境因素對蛋白質聚集和伴侶分子伴護效果的影響、如何進行...
根據研究計畫,在本項目執行中,我們運用凝聚態與統計物理和非線性動力學等學科的概念和方法,並結合生物物理實驗手段,圍繞擁擠環境、分子電荷性質、金屬離子輔助因子誘導蛋白質構象運動、含硫鍵蛋白質的摺疊、以及蛋白質-蛋白質相互作用介導的與功能相關的動力學等問題,開展了多方面的深入研究。同時針對其他複雜相互作用...
擁擠環境的產生包括體系內其他分子產生的擁擠和高分子鏈本身在受限環境下或在發生塌縮時產生的鏈段間擁擠。 按照研究計畫,完成的工作要點如下:(1)研究了分子擁擠環境下蛋白質與DNA的相互作用機制,包括DNA結合蛋白搜尋靶向位點,類組蛋白結合效應下的細菌染色體鏈分離。同時我們研究了高分子在劣溶劑中鏈塌縮時產...
日本科學家發現了一系列前所未知的蛋白質摺疊。前言 結構決定功能,僅僅知道基因組序列並不能使我們充分了解蛋白質的功能,更無法知道它是如何工作的。蛋白質可憑藉相互作用在細胞環境(特定的酸鹼度、溫度等)下自己組裝自己,這種自我組裝的過程被稱為蛋白質摺疊。蛋白質摺疊問題被列為“21世紀的生物物理學”的重要...
(2)最近的哺乳動物細胞實驗結果表明在細胞擁擠環境中,MAPK級聯反應能夠由分布型磷酸化過渡到過程型磷酸化機制,我們建立了蛋白質混合型磷酸化機制的數學模型,並引進了細胞擁擠因子和過程型比率係數,模擬結果顯示:調節過程型比率能夠定性改變MAPK信號模組的動力學回響,使得該級聯模組在振盪、雙穩以及超靈敏性等狀態...
但在實際研究中發現,在體外摺疊時,蛋白質分子間由於存在大量錯誤摺疊和聚合,復性效率往往很低。究其原因,蛋白質的立體結構雖然由其胺基酸順序決定,然而伸展肽鏈摺疊為天然活性結構的過程還受到周圍環境的影響。摺疊機制 為了有的放矢地開發輔助蛋白質復性的技術,研究工作者紛紛開展了對蛋白質摺疊機制的探討。有兩種...
這些研究既豐富了人們對蛋白質摺疊機理的認識,也為模仿蛋白質的摺疊、聚集機制來製備功能生物材料奠定了基礎。 重要的研究結果包括:1.提出了在生物體內,許多蛋白質分子處於受力環境,其摺疊與功能均收到外力的調控的思想。我們發現凝溶膠蛋白的摺疊與構象變化在10pN的外力存在下與不受力的情況存在顯著差異,這為...
2001-2002年在法國Louis Pasteur大學藥理學與物理化學國家重點實驗室(CNRS)做訪問教授(合作教授:Jacques Haiech教授)。2006-2007年在美國國立健康研究院(NIH)生物化學與遺傳學實驗室做訪問教授(合作教授:Allen P. Minton 教授)。研究方向 主要研究領域和興趣 (1)體外和生理擁擠環境中蛋白質摺疊和錯誤摺疊機制;(...