《心肌梗死中microRNA和轉錄因子前饋環調控網路及驗證》是依託華中科技大學,由郭安源擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:心肌梗死中microRNA和轉錄因子前饋環調控網路及驗證
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:郭安源
- 依託單位:華中科技大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
心肌梗死是威脅人類生命的嚴重疾病和受多因素影響的複雜疾病,其具體病理機制還有待進一步研究。轉錄因子(TF)和miRNA都是在複雜疾病中起重要作用的調節因子,但其共調控的研究較少。本項目在前期工作基礎上,首先擬整合多種預測方法和實驗數據預測miRNA和TF的靶基因,系統構建全基因組水平的miRNA-TF-靶基因共調控前饋環模組。然後結合我們已構建的心肌梗死基因資料庫和miRNA相關SNP資料庫,系統分析心肌梗死中的miRNA-TF共調控模組和網路以及miRNA相關SNP對該調控網路的影響,預測心肌梗死中重要的miRNA-TF共調控模組和調節因子。最後通過實驗驗證核心調控模組的存在,並在心肌細胞和心肌梗死動物模型中分析核心調控模組和調節因子的作用。本項目為揭示心肌梗死發病的調控機理並尋找潛在生物靶標提供理論基礎,具有重要的套用價值,也為複雜疾病的研究提供新的交叉研究思路,具有重要的學術意義。
結題摘要
心肌梗死是世界範圍內的一大導致人類死亡的主要疾病,針對心肌梗死的大量研究包括全基因組關聯分析等發現了許多心肌梗死相關的基因。然而這些基因間的調控機制和調控網路尚不清楚。申請人通過收集心肌梗死相關的基因和miRNA,構建心肌梗死的轉錄因子和miRNA共調控網路,並通過統計檢驗和子網路分析驗證了該網路與心肌梗死的關係,預測了一些核心調控因子的重要功能。同時我們發現網路中的很多預測調控關係可以作為橋樑串聯以前的一些文獻結果,如miR-29在介導纖維化、血管生成和細胞凋亡中都參與調控。進一步針對心肌梗死復發與未復發病人的表達數據,我們篩選了差異基因,構建了可能與心肌梗死復發相關的轉錄因子和miRNA調控網路。對該復發相關調控的分析發現了一些可能作為心梗復發標誌的調控模組和基因,如MAX/miR-320a/BMP6調控模組。最後我們基於這些分析和已有的知識,構建了一個心肌梗死相關的調控網路的細胞模型,列出了其中重要的基因和調控因子及其調控關係。這些研究為心肌梗死的疾病進展和復發提供了新的調控機制並且聯繫和解釋了以前的一些零散實驗結果,為深入了解心肌梗死提供新的視角。