循環閾值

循環閾值

循環閾值(Cycle threshold,Ct值)的含義為:每個反應管內的螢光信號到達設定閾值時所經歷的循環數。

循環閾值是實時螢光定量多聚核苷酸鏈式反應(Real-time Quantitative polymerase chain reaction)中的一個重要參數,由它可以繪製出標準曲線,進而檢測待測樣品中模板的起始拷貝數。

基本介紹

  • 中文名:循環閾值
  • 外文名:Ct值
  • 涉及技術:PCR
螢光閾值(threshold)的設定,Ct值與起始模板的關係,

螢光閾值(threshold)的設定

PCR反應的前15個循環的螢光信號作為螢光本底信號,螢光閾值的(默認)設定是3-15個循環的螢光信號的標準偏差的10倍,即:threshold = 10*SDcycle 3-15

Ct值與起始模板的關係

每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數的對數存線上性關係,公式如下。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)
n為擴增反應的循環次數,X0為初始模板量,Ex為擴增效率,N為螢光擴增信號達到閾值強度時擴增產物的量。
起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值。因此,只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數。

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