張掖飛禽保護區位於張掖國家濕地公園內，總投資518萬元，由市林業局總體負責。沿張掖國家濕地公園電瓶車道分為南北兩區，規劃總面積2300畝。是重點以野生水禽和人工馴化成熟的飛禽保護為主,在儘量保持原生態景觀的前提下，進行一些必要的基礎設施建設，主要建設內容有半封閉的網圍欄、棚舍、產蛋孵化巢、人員管護用房、宣傳牌、警示牌等基礎設施的建設。保護區以保持現有原生態景觀為主，重點建設開放式野生飛禽保護區，依託區域水生植物與林草地分布現狀，引進種源並開展人工孵化繁殖工作。
計畫先期引進黑天鵝、白天鵝、鴨類、等7-8個品種的水禽進行試驗性馴化、繁育，待馴化、繁育技術成熟後再引進一些觀賞性更高的鶴類進行馴化、繁育。通過人工定點定時投食和孵化繁育，一方面擴大種群數量和增加品種的多樣性，另一方面吸引野生飛禽前來覓食，延長停留時間，從而提高濕地公園的觀賞品味。
