序列特異性引物分析

序列特異性引物分析即根據各等位基因的核苷酸序列，設計出一套針對每一等位基因特異性的或組特異性的引物，此即為序列特異性引物(SSP)。SSP只能與某一等位基因特異性片段的鹼基序列互補性結合，通過PCR特異性地擴增該基因片段，從而達到分析基因多態性的目的。

由於PCR技術的套用，使得DNA 測序技術從過去的分子克隆後測序進入PCR直接測序。PCR產物在自動測序儀上電泳後測序。常用方法有:Sanger雙脫氧末端終止法;Maxam-Gilbert化學裂解法;DNA測序的自動化。目前DNA順序全自動雷射測定法是最先進的方法。