序列標記微衛星是天文學術語。染色體上已定位的、核苷酸序列已知的微衛星重複序列。套用學科：遺傳學（一級學科）；基因組學（二級學科）。
| 中文名稱 | 序列標記微衛星 |
| 英文名稱 | sequence tagged microsatellite;SIMS |
| 定 義 | 染色體上已定位的、核苷酸序列已知的微衛星重複序列。 |
| 套用學科 | 遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科） |
序列標記微衛星是天文學術語。染色體上已定位的、核苷酸序列已知的微衛星重複序列。套用學科：遺傳學（一級學科）；基因組學（二級學科）。是均勻分布於真核⽣物基因組中的簡單重複序列，由2～6個核苷酸的串聯重複⽚段構成，由於重複單...
微衛星標記（microsatellite），又被稱為短串聯重複序列(short tandem repeats,STRs)或簡單重複序列（simple sequence repeats，SSR），是均勻分布於真核生物基因組中的簡單重複序列，由2～6個核苷酸的串聯重複片段構成，由於重複單位的重複次數在個體間呈高度變異性並且數量豐富，因此微衛星標記的套用非常廣泛。微衛星位點...
簡單重複序列（Simple Sequence Repeat，簡稱SSR），是指重複單位長度和鹼基組成基本一致，只有少數基因出現微小的差異的一類短串聯重複序列。SSR是以PCR技術為核心的DNA分子標記技術。術語簡介 1982年，Hamade等人發現了簡單重複序列標記(SSR)技術，或稱微衛星序列標記(Microsatellite sequence，MS)，或短串聯重複標記( ...
簡單重複序列標記（Simple Sequence Repeats標記，簡稱SSR標記）是一種以特異引物PCR為基礎的分子標記技術，也稱為微衛星DNA(MicrosatelliteDNA)，是一類由幾個核苷酸（一般為1~6個）為重複單位組成的長達幾十個核苷酸的串聯重複序列。每個SSR兩側的序列一般是相對保守的單拷貝序列。生物的基因組中，特別是高等生物的基因...
衛星DNA標記（microsatelliteDNA）是近十多年發展起來的一種新型的分子遺傳標記。它具有數量大、分布廣且均勻、多態信息含量高、檢測快速方便等特點，已經被廣泛套用於動、植物基因定位、連鎖分析、血緣關係鑑定、遺傳多樣性評估、系統發生樹構建、標記輔助選擇等方面。微衛星DNA又稱短串聯重複序列（shorttandemrepeat,STR）...
多態性信息豐富、易於檢測等優點被作為優良的遺傳標記(genetic marker)而得到廣泛套用。基序 Motif 微衛星中重複單元（Motif）。例如ATATATATATATATATATATATAT序列中，AT就是該序列的重複單元，在重複單元的劃分上，一般認為：CA = AC = GT = TG AGC = GCA = CAG = GCT = CTG = TGC ...
微衛星DNA，重複單位序列最短，只有1～6bp，串聯成簇，長度50～100bp，又稱為短串聯重複序列（Short Tandem Repeat STR）。廣泛分布於基因組中。 其中富含A-T鹼基對，是在研究DNA多態性標記過程中發現的。1981年Miesfeld等首次發現微衛星DNA，其重複單位長度一般為1～6個核苷酸，雙核苷酸重複單位常為(CA)n和(TG...
《鱸魚基因內微衛星標記連鎖圖譜構建》是依託中國海洋大學，由楊官品擔任項目負責人的面上項目。 中文摘要 在育苗親本中進行一對一親本雜交，用假測交方法獲得作圖群體；從cDNA文庫中分離含微衛星的功能基因序列，並根據這些序列設計微衛星標記引物；構建鱸魚基因內微衛星標記連鎖圖譜。由於作圖群體和其他研究群體獲得方法...
利用GenBank的植物DNA序列數據及生物信息學技術，設計開發新的DNA ISSR(Inter-simple Sequence Repeats)引物。研究構建利用微衛星DNA分子標記對中國牡丹品種的鑑定與遺傳評價技術體系。進而，提出中國牡丹品種種質資源的保護與利用對策。本項目對促進牡丹品種鑑定的規範化、標準化和科學化、推動中國牡丹花卉產業的發展具有...
微衛星引物開發由於許多物種的全基因組序列尚未公布，無法根據序列設計SSR位點引物，SSR引物對SSR分子標記技術的套用至關重要，從而阻礙了科研的進行。四種途徑 1.相關文獻；2.近緣種的引物；3.資料庫搜尋法：利用專門的 SSR 分析軟體，搜尋 GenBank、EMBL和DDBJ 等公共資料庫中的 DNA 序列和 EST 序列獲得 SSR ...
《基於微衛星序列[TTAGGG]n的C2H2型鋅指結構域的設計》是趙東欣為項目負責人，河南工業大學為依託單位的青年科學基金項目。科研成果 項目摘要 人染色體端粒末端的[TTAGGG]n重複DNA序列是基因組中重要的微衛星家族之一，影響著染色體的結構、基因的轉錄與翻譯等過程，與多種癌症相關。因此，獲得能與[TTAGGG]n特異性結合...
微衛星無效等位基因主要是由於SSR側冀序列突變等導致基因無法正常擴增, 它可以通過改變引物與側翼序列的結合位點來消除或避免。如果新引物能有效擴增某基因片段, 此時該位點就不存在無效等位基因。可見, 微衛星無效等位基因與引物的結合位點(變異)直接相關, 並非基因本身的自然特性。
SSR標記的基本原理：根據微衛星序列兩端互補序列設計引物，通過PCR反應擴增微衛星片段，由於核心序列串聯重複數目不同，因而能夠用PCR的方法擴增出不同長度的PCR產物，將擴增產物進行凝膠電泳，根據分離片段的大小決定基因型並計算等位基因頻率。SSR具有以下一些優點：（l）一般檢測到的是一個單一的多等位基因位點；⑵微...
本項目首次開發了番石榴果實蠅微衛星標記體系，並以此為基礎利用微衛星標記技術與mtDNA COI序列分析技術相結合的方法，研究了番石榴果實蠅種群遺傳結構，研發並運用實蠅種群遺傳結構地理信息系統（TpGIS），揭示了番石榴果實蠅在中國的入侵來源和擴散，明確了其在世界主要分布區內的擴散路線。通過利用微衛星標記技術對來...
《（CGG:GCC）短重複序列結合蛋白的大規模篩選和功能研究》是依託中山大學，由吳蘇擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 近年研究發現，基因組非編碼序列中的短重複序列（微衛星序列）不僅是染色體某些特殊結構的組成部分（如端粒），有些對基因轉錄調控也具有重要作用。（CGG:GCC）三聯短重複序列顯著性出現在...
ISSR(inter-simple sequence repeat)是Zietkiewicz等於1994年發展起來的一種微衛星基礎上的分子標記。其基本原理是:用錨定的微衛星DNA為引物，即在SSR序列的3'端或5'端加上2-4個隨機核苷酸，在PCR反應中，錨定引物可引起特定位點退火，導致與錨定引物互補的間隔不太大的重複序列間DNA片段進行PCR擴增。所擴增的...
（1）非轉錄序列要多於轉錄序列 （2）在轉錄區非同義突變的頻率, 比其他方式突變的頻率低得多。SNP的特點 在遺傳學分析中，SNP作為一類遺傳標記得以廣泛套用, 主要源於這幾個特點:密度高 SNP在人類基因組的平均密度估計為1\1000 bp , 在整個基因組的分布達3×10⁶個，遺傳距離為 2～3cM，密度比微衛星標記更...
利用該軟體從基因組中共搜尋到完美型微衛星335,263個，其中四鹼基微衛星45575個，占13.59%，為四川山鷓鴣四鹼基微衛星標記的開發和套用奠定了基礎。挑選重複次數大於15次的四鹼基微衛星序列設計了35對PCR引物，共篩選出18對擴增穩定、多態性好的微衛星標記，對四川山鷓鴣老君山種群24個個體的多態性分析表明，平均等位...
本研究綜合運用了形態學、線粒體DNA序列和微衛星標記分析等多種方法對棱梭的群體遺傳多樣性和遺傳結構進行了系統研究，揭示了歷史地理事件、生態環境因子和魚類自身習性等因素對海洋魚類地理系統格局的共同影響。主要研究結果如下：（1）形態特徵分析和DNA條形碼研究的結果均支持中國近海棱梭的拉丁名應為Liza affinis...
微衛星DNA標記microsatellite，指以2－7個鹼基為核心串聯重複而成的一類序列（微衛星DNAmicrosatelliteDNA，又稱為STRshorttandemrepeat短串聯重複序列），由於核心序列重複數目的變化而在群體中呈現出遺傳多態性，但在同一家系內具有高度的遺傳保守性，以孟德爾方式遺傳，散布於整個基因組中。SNPsinglenucleotidepolymorphism...
短串聯重複序列（STR），又稱微衛星DNA（microsatellite DNA），STR檢測技術主要是通過對這些特異性STR位點的多態性進行檢測，在獲得了多個相應STR位點的信息後，進行多位點信息的平行比對，從而實現了個體識別和親權鑑定。STR檢測以其特有的技術優勢，幾十年來一直是法醫遺傳學研究的熱點和核心，並被廣泛套用於法醫學...
(3)分子雜交所用DNA探針核苷酸序列必須是小衛星序列或微衛星序列，通過分子雜交和放射自顯影后，就可一次性檢測到眾多小衛星或微衛星位點，得到個體特異性的DNA指紋圖譜。 小衛星標記的多態信息含量較高，在17一19之間。缺點是數量有限，而且在基因組上分布不均勻，這就極大限制其在基因定位中的套用。VNTR也存在實驗...
人工合成的簡單重複序列微衛星探針也廣泛地用於DNA 指紋分析，如（GTG）5 、（TG）8、（AT）8、（TCC）5 、（GACA）4。從基因組中分離克隆的微衛星DNA 指紋探針有PGB725 （牛）（Kashi 等 1990）和 R18.1 （豬）（Haberfield 等 1991）。 孟安明（1993）發現，任何一個動物個體的基因組總DNA 可標記作為...
