巴彥淖爾市農畜產品質量安全中心成立於1997年，前身是巴彥淖爾盟綠色食品發展中心，是隸屬於巴彥淖爾市農牧業局的科級建制的事業單位。
主要職責,內設機構,
主要職責
主要職能是：開展對《農產品質量安全法》的宣傳與實施工作；對全市符合無公害農畜水產品、綠色食品、有機食品、農產品地理標誌等相關標準的產品開展認證認證和組織實施、審核、推薦、上報工作；實施對獲證產品的生產過程、產後質量、產地環境跟蹤檢查的質量控制工作；對全市無公害食品、綠色食品、有機食品生產加工企業和生產基地進行質量監督管理和市場監督管理；開展與認證相關的技術諮詢、技術培訓、技術指導、技術宣傳等工作。中心內設綜合管理科、無公害農產品標誌管理科、綠色食品標誌管理科、有機食品標誌管理科、農產品地理標誌管理科、市場監管科六個職能科室。
內設機構
綜合科
1、獨立完成巴彥淖爾市“三品”統計數據匯總分析及單位財務預決算
2、完成本單位日常財務核算、資產清核、辦公用品購置、物品保管發放工作、以及人事勞資、醫保、福利等各項後勤保障工作。
3、配合其他各部做好各項業務工作，完善落實並監督執行中心的各項規章制度。
4、完成本單位的安全保衛工作。負責好水、電、暖以及防火、防盜、防泄密和車輛安全運行工作。
5、完成各種會議的會務準備及後勤工作。
6、服從和配合局機關及辦公室、財務科、審計科的業務指導。
7、完成本單位的年度統計和對外信息交流。
8、完成領導交辦的其他工作任務。
無公害農產品標誌管理科
1、擬定本級無公害農畜水產品發展規劃和計畫。
2、檢查監督無公害農產品生產單位標誌使用的執行情況，原料、產成品的倉儲衛生等。基地生產肥料、農藥使用準則執行情況及指導服務工作。
3、協助自治區農產品質量安全中心抓好本地區申報無公害農產品標誌生產單位的材料、表格的審核工作。
4、準確、及時地統計無公害農產品生產單位的生產、銷售情況。
5、負責“放心菜”生產基地的申報、管理及檢查工作。
6、負責標準化工作的擬寫、制定、實施和資料的發放工作。
7、做好無公害農產品生產單位的半年和年度檢查、評比工作。
8、完成領導交辦的其它工作任務。
綠色食品標誌管理科
1、擬定綠色食品發展規劃和計畫並組織實施。
2、做好綠色食品標誌管理和市場調查研究。
3、協助內蒙綠色食品發展中心負責本地區申報綠色食品標誌企業的材料初審、表格的審核。
4、積極開展綠色食品產品質量監督管理工作，檢查督促綠色食品生產企業嚴格執行《綠色食品使用協定》。
5、負責全市綠色食品申報材料的審核工作。
6、抓好企業的基地管理工作，
7、抓好全市綠色食品生產、銷售的統計工作，分析全市綠色食品發展動態
8、組織全市綠色食品企業年終檢查評比，並寫出總結材料。
9、完成領導交辦的其它工作任務。
有機食品標誌管理科
1、制定全市有機食品發展規劃，按時完成市里下達的有機食品目標任務；
2、抓好有機食品企業生產基地建設管理、方案的制定及實施工作；抓好企業從生產到銷售各環節記錄及檔案整理工作；
3、負責制定有機食品知識宣傳培訓計畫及實施工作，對有機食品企業生產基地人員、管理人員、技術人員及員工積極開展相關知識的技術培訓；
4、負責抓好申報有機食品標誌使用權企業的材料審核、整理、上報及歸檔管理工作。
5、及時傳達上級業務部門保持認證通知，要求有機食品企業按要求完成；
6、協助有機食品檢查員抓好對有機食品企業進行實地檢查和原料基地的環境監測工作，提出一些合理化的建議或意見；
7、抓好有機食品標誌使用權企業的基地檢查、生產過程監控、產品質量監管和技術諮詢服務工作。檢查管理有機食品生產企業《有機食品標誌使用協定》執行情況，要求企業各個生產環節嚴格按照有機產品標準操作；
8、做好有機食品生產、銷售的統計工作，積極開展市場調研；
9、完成領導交辦的其它工作任務。
農產品地理標誌管理科
1、協助內蒙古農產品質量安全中心負責抓好地理標誌申報的諮詢、技術指導和考察期間的技術培訓工作。
2、協助自治區農產品質量安全中心完成申報單位的實地考察和環境監測、食品檢測的溝通與聯絡工作。
3、協助內蒙農產品質量安全中心完成申報材料的初審工作，提出初審意見，並根據考察情況、企業上報材料進行研究，對企業提出有針對性的整改規範意見材料。
4、完成地理標誌年度匯總和統計工作。
5、負責業務檔案蒐集、整理工作。
6、負責農產品地理標誌相關信息統計、報送。
7、組織開展對農產品地理標誌申報單位管理人員、專業技術人員培訓。
8、組織管理農產品地理標申報單位進行日常性工作交流。
9、完成領導交辦的其它工作任務。
市場監管科
1、負責無公害食品、綠色食品、有機食品生產加工企業的質量監督管理和市場監督管理。
2、負責協調工商、技術監督等部門做好無公害食品、綠色食品、有機食品的市場清理整頓，打擊假冒偽劣無公害食品、綠色食品、有機食品。
3、負責對已獲標誌使用權的企業進行規範化管理，並且協助自治區中心對“三品”生產加工企業進行年度檢查、證書年檢蓋章及市場抽樣檢測等工作。
4、負責無公害食品、綠色食品、有機食品生產過程的質量控制管理工作，對無公害食品、綠色食品、有機食品原料來源、購銷票據及契約的履行進行監督管理。
5、負責“三品”廣告用語的起草撰寫和“三品”生產企業的參展工作與流通服務網路體系建設，
6、負責名牌產品的申報、審核、登記、備案等工作。
7、指導和管理無公害食品、綠色食品、有機食品市場準入和專營店、專櫃等工作。
8、負責無公害、綠色、有機食品生產企業的產品公告工作，並做好信息收集及網站內容更新發布工作。
9、負責抓好年初工作的計畫安排、半年的工作總結、年終的工作總結、統計數據的上報工作
10、完成領導交辦的其它工作任務。
