動物生物工程與疾病防治實驗室依託山東農業大學，下設動物胚胎工程與種質創新利用、動物營養生理、疾病防治和蠶業工程技術四個研究方向。
1、動物胚胎工程與種質資源創新利用：主要從事動物胚胎髮育生物學、高效胚胎工程產業化技術、分子育種原理與技術、現代動物育種理論與技術和動物種質資源保護與開發利用理論與技術等方面的研究，在動物胚胎工程、動物克隆技術方面的多項研究居國內領先地位，在分子育種、數量遺傳、畜禽新品種（系）選育等方面具有較強研究實力。
2、動物疾病防治研究方向：主要從事分子病原學、分子免疫學、分子病理學、動物傳染病診斷與防治等方面的研究，在禽免疫抑制性和腫瘤性病毒研究方面的多項研究工作居國內領先水平，在畜禽傳染性疾病病源學與診治技術、病源氣溶膠傳播規律、生物製劑等方面具有較強的研究實力。 3、動物營養生理研究方向：主要從事分子營養學、物質代謝動力學、環境營養學、動物營養工程技術等方面的研究，在家禽營養生理、家禽環境營養、反芻動物營養生理等方面的多項研究工作居國內領先水平，在主要畜禽營養需要量、飼料營養價值評定、飼料加工等方面具有較強研究實力。 4、蠶蜂工程技術研究方向：主要從事蠶蜂病理與疾病防治、蠶蜂生理與養殖新技術、蠶蜂蠶桑種質資源開發利用、基於蠶蜂的生物製品與功能製品開發技術等方面的研究，在家蠶育種、蠶病防治、家蠶攝氏行為等方面的多項研究居國內領先地位，在蠶、蜂分子生物學及產業化工程技術等方面具有較強的研究實力。 本實驗室建設是我省畜牧獸醫科學研究的重大基礎工程，建設的總體目標是以生物技術和信息技術套用為重點，形成我省畜牧獸醫基礎科學理論和重大高新技術創新的源頭高地，為發展我省的現代畜禽育種產業、現代動物生物工程產業和發展現代畜牧生產技術、現代獸醫技術，建立安全、優質、循環的可持續現代畜牧生產系統提供源頭創新支撐。
