專案審計是重大的財經法紀審計事項。對嚴重違反財經法紀並構成經濟犯罪行為應予立案而進行的審計。如嚴重侵占截留國家資財,嚴重損失浪費,貪污盜竊等損害國家和集體利益的審計案件。屬於專案審計,一般涉及觸犯刑律或應受到黨紀、政紀的紀律制裁及應提請司法機關或移送監察或有關部門處理的審計事項。
專案審計一般是通過立案後進行,專案審計按其性質分為大案、要案、窩案、串案、畸案。專案審計的案件來自三個方面:上級指令;民眾舉報;審計人員在進行專項審計、專題審計和其他方面審計時發現的重大經濟案件線索通過移送立案後進行的審計,如貪污、挪用,收受賄賂等。