內容簡介
本書詳細闡述了miRNA的基礎理論,並針對醫藥衛生研究者的特點,注重實踐操作,對不同技術方法的可行性及局限性進行了詳細的論述。同時,本專著還包含了作者近年來在miRNA研究實踐中的一些發明及對最新技術套用的體會,有助於miRNA研究人員在實際科研工作中揚長避短,節省時間,獲得最佳研究成果。
圖書目錄
第1篇miRNA的基礎理論
緒論
第1章miRNA的發現及其進化史
第1節miRNA的發現
二、let7的發現及其在動物中的保守性
三、動物中其他的miRNA
四、植物中的miRNA
五、動物和植物miRNA的區別
第2節miRNA基因的進化
第3節動物中miRNA功能的保守性
第2章miRNA基因組、表達模式與命名原則
第1節miRNA的編碼基因在基因組中的位置
第2節miRNA基因組的表達模式
第3節miRNA的命名規則
第3章miRNA的生物合成
第1節概述
第2節細胞核內miRNA編碼基因的轉錄與轉錄初產物剪接、加工過程
第3節premiRNA經exportin5由細胞核輸出
第4節Dicer加工及miRNA的成熟
第4章miRNA的功能及作用機制
第1節miRNA的功能
第2節miRNA的作用機制
一、RNA誘導沉默複合體(RISC)的形成
二、miRNA誘導的基因沉默模式及其相關機制
第3節miRNA的周轉與修飾
第4節miRNA表達研究
第5節miRNA靶標的預測及miRNA研究的相關資料庫
一、miRNA的預測原則
二、miRNA鑑定與預測軟體簡介
第6節人類基因組中miRNA基因的組成
第7節人工miRNA
第8節結語
參考文獻
第2篇miRNA與醫學
第5章miRNA與發育
一、生殖細胞的發生
二、胚胎早期發育的基本過程
三、miRNA與生殖細胞的發育
四、miRNA與胚胎早期發育
參考文獻
第2節miRNA在腎臟發育中的作用
一、腎臟的基本結構
二、腎臟的發生
三、miRNA與腎臟發育
四、miRNA在腎臟發育中的時序性調控
參考文獻
第3節miRNA在血液及免疫
系統發生中的作用
一、血細胞的發生
二、miRNA調控
造血幹細胞定向分化潛能和自我更新
五、miRNA與血小板發生
六、miRNA與紅細胞發生
參考文獻
第4節miRNA在心血管系統發育中的作用
一、心血管的結構及其發生
三、miRNA與心臟發育
四、miRNA與血管發育
參考文獻
第5節miRNA在神經系統發育中的作用
一、神經系統的基本結構
二、神經系統的發生
五、miRNA與神經元成熟及突觸形成
參考文獻
第6節miRNA在消化系統發育中的作用
一、miRNA與胰腺的發育
二、miRNA與肝臟的發育
參考文獻
第6章miRNA與腫瘤
第1節miRNA與腫瘤的發生和發展
一、腫瘤中miRNA異常表達與調控
二、miRNA作為癌基因及抑癌基因
三、miRNA與腫瘤的侵襲和轉移
參考文獻
第2節miRNA與細胞凋亡
一、miRNA與Bcl2 家族
二、miRNA與p53
三、miRNA與cMyc
四、miRNA與caspase
五、miRNA與PDCD4
六、miRNA與凋亡信號轉導途徑
七、miRNA誘導細胞凋亡的調控環路
參考文獻
第3節miRNA與腫瘤的診斷
三、miRNA作為腫瘤標記物待解決的問題
參考文獻
第4節miRNA與腫瘤研究及治療
一、下調miRNA的功能與腫瘤研究及治療
二、上調miRNA的功能與腫瘤研究及治療
三、miRNA治療研究中常用的載體系統
四、干擾miRNA功能的藥物
五、miRNA與腫瘤化療
參考文獻
第5節miRNA與各系統腫瘤
一、miRNA與乳腺癌
三、miRNA與結、直腸癌
四、miRNA與肺癌
五、miRNA與卵巢癌
六、miRNA與急性髓性白血病
參考文獻
第7章miRNA與病毒性疾病
第1節病毒編碼的miRNA生物起源
第2節病毒miRNA的功能
一、病毒編碼miRNA及其對病毒mRNA的表達調節
二、病毒編碼miRNA的特點
三、病毒編碼的miRNA對宿主基因的調控
第3節宿主miRNA對病毒感染的影響
二、miRNA對病毒複製的間接影響
第4節miRNA在病毒發病過程中作用的局限性
第5節不同類型病毒的miRNA
一、EB病毒編碼的miRNA
二、HIV病毒相關miRNA
三、SV40編碼的miRNA
五、其他病毒編碼的miRNA
第6節病毒、miRNA與腫瘤
第7節套用與展望
參考文獻
第8章miRNA與人類其他疾病
第1節miRNA與內分泌疾病的概述
一、miRNA與糖尿病
二、miRNA與脂代謝
三、結語
參考文獻
一、miRNA與神經系統疾病概述
二、miRNA與神經退行性疾病
三、miRNA與神經細胞凋亡相關性疾病
四、miRNA與其他神經系統疾病
五、小結
參考文獻
第3節miRNA與造血及血液系統疾病
一、miRNA在血液系統疾病中的研究
二、結論與展望
參考文獻
第4節miRNA與心血管系統疾病
一、正常心臟中的miRNA
二、miRNA與心血管系統相關
疾病
參考文獻
第9章miRNA在臨床疾病診斷與治療中的套用前景
第1節miRNA在臨床治療中的套用前景
一、miRNA作為臨床診治標誌物的研究現狀
二、miRNA介導的基本治療方
三、miRNA介導的臨床治療所面臨的機遇與挑戰
第2節miRNA在相關疾病中的套用前景
一、miRNA在內分泌系統疾病中的治療靶點及其套用
三、miRNA在造血系統疾病中的治療靶點及其套用
四、miRNA在循環系統疾病中的治療靶點及其套用
五、miRNA在病毒性疾病中的研究及其套用
第3節結語
參考文獻
第3篇miRNA相關檢測技術
第10章miRNA提純技術
第1節miRNA在新鮮組織及冰凍組織中的提純
一、簡介
二、實驗方法
第2節miRNA在福馬林固定石蠟包埋組織中的提純
一、簡介
二、實驗方法
第3節miRNA在細胞中的提純
一、簡介
二、實驗方法
三、試劑
四、操作過程
第4節miRNA在血清中的提純
一、簡介
二、實驗方法
參考文獻
第11章miRNA晶片技術
第1節簡介
第2節實驗方法
一、材料
二、儀器設備
三、試劑
四、操作過程
五、套用與限制
參考文獻
第12章印跡雜交技術
第1節簡介
第2節實驗方法
一、材料
二、儀器設備
三、試劑
四、操作過程
五、套用與限制
參考文獻
第1節探針
第2節雜交步驟
一、雜交前準備
二、細胞和組織切片的雜交前預處理
三、雜交
四、雜交後處理
五、顯示
六、對照
一、儀器設備
二、試劑
三、試劑配方
四、操作步驟
第4節冰凍切片miRNA的原位雜交法
一、儀器設備
二、試劑
三、試劑配方
四、操作步驟
第5節整體原位雜交法
一、簡介
二、儀器設備
三、試劑
四、試劑配方
五、操作步驟
一、ultramer寡核苷酸擴展法
二、連續切片法原位檢測miRNA、mRNA及靶蛋白
參考文獻
第1節序言
參考文獻
第2節終點莖環實時RTPCR法對miRNA的定量檢測
一、簡介
二、實驗方法
三、套用與限制
參考文獻
第3節miRNA全定量RTPCR法(miRQ)
一、簡介
二、實驗方法
三、套用與限制
參考文獻
第4節Poly(A)加尾性反轉錄法
一、簡介
二、實驗方法
三、套用與限制
參考文獻
第5節miRNA表達譜的RTPCR微陣列分析
一、簡介
二、實驗方法
三、套用與限制
參考文獻
第6節miRNA擴增譜系(miRAP)
一、簡介
二、實驗方法
三、套用與限制
參考文獻
第7節miRNA的實時、
定量PCR技術套用實例分析
一、導言
參考文獻
第15章克隆技術
第1節簡介
第2節實驗方法
一、材料
二、儀器設備
三、試劑
四、操作過程
第3節套用與限制
參考文獻
第16章血清和血漿中miRNA的檢測技術
第1節簡介
第2節實驗方法
一、材料
二、儀器設備
三、試劑
四、操作過程
第3節套用與限制
參考文獻
第17章母系血漿中胎盤miRNA的檢測
第1節簡介
第2節實驗方法
一、材料
二、儀器設備
三、試劑
四、操作過程
第3節套用與限制
參考文獻
第18章單一細胞內miRNA的檢測
第1節簡介
第2節實驗方法
一、用莖環RTqPCR法檢測單個人
胚胎幹細胞中的miRNA
二、LNAELFFISH方法
第3節套用與限制
參考文獻
第19章miRNA功能報告基因表達檢測技術
第1節簡介
第2節實驗方法
一、以Fluc為報告基因的miRNA感測器(以hsamiR223為例)
二、利用分泌型螢光素酶基因表達
變化監測活細胞中miRNA活性的新方法
第3節套用與限制
參考文獻
第20章miRNA靶基因預測與鑑定
第1節引言
第2節miRNA靶基因的生物信息學預
測及常用靶基因預測軟體
一、簡介
二、軟體使用方法
三、套用與限制
第3節miRNA靶基因的鑑定
一、miRNA 模擬物(或靶基因siRNA)瞬時轉染細胞實驗
二、用報告基因法確定miRNA靶基因
第4節miRNA相關資料庫
一、簡介
二、miRNA靶基因資料庫使用方法
三、套用與限制
參考文獻
英漢索引