外生親和試劑一般用於酶的親和標記,親和試劑一般可分為內生親和試劑和外生親和試劑,前者是指試劑本身的某部分通過化學方法轉化為所需要的基團,而對試劑的結構沒有大的擾動;後者是把反應性基團加入試劑中去,如將鹵代烷基衍生物連到腺嘌呤上。
基本介紹
- 中文名:外生親和試劑
- 外文名:External affinity reagents
- 親和試劑:內生親和試劑和外生親和試劑
- 外生親和試劑:試劑本身的某部分轉化為所需基團
- 內生親和試劑:把反應性基團加入試劑中
- 套用:酶的親和標記
酶的親和修飾,親和標記,外生親和試劑與光親和標記,
酶的親和修飾
酶的親和修飾(Affinity Modification of Enzyme),又稱酶的位點專一性修飾,是根據酶和底物的親和性,使用既能與被作用基團和作用部位具有專一性又可與活性中心的基團形成穩定的共價鍵的修飾劑對酶的修飾。用於親和修飾的修飾劑稱為親和修飾劑,也稱為位點專一性抑制劑,這類修飾劑不僅具有對被作用基團的專一性,而且具有對被作用部位的專一性,即修飾劑作用於被作用部位的某一基團,而不與被作用部位以外的同類基團發生作用。一般它們都具有與底物相類似的結構,對酶活性部位具有高度的親和性,能對活性部位的胺基酸殘基進行共價結合或標記,因此這類專一性化學修飾也稱為親和標記或專一性的不可逆抑制。
親和標記
雖然已開發出許多不同胺基酸殘基側鏈基團的特定修飾劑並用於酶的化學修飾中,但是這些試劑即使對某一基團的反應是專一的,也仍然有多個同類殘基與之反應。因此對某個特定殘基的選擇性修飾比較困難。為了解決這個問題,開發了親和標記試劑。
用於親和標記的親和試劑作為底物類似物應符合如下條件:在使酶不可逆失活以前,親和試劑要與酶形成可逆複合物;親和試劑的修飾程度是有限的;沒有反應性的競爭性配體的存在就應減弱親和試劑的反應速度;親和試劑體積不能太大,否則會產生空間障礙;修飾產物應當穩定,便於表征親和量。
親和試劑可以專一性地標記於酶的活性部位上,使酶不可逆失活,因此也稱為專一性的不可逆抑制。這種抑制又分為Ks型不可逆抑制和Kcat型不可逆抑制。Ks型抑制劑是根據底物的結構設計的,它具有和底物的結構相似的結合基團,同時還具有能和活性部位胺基酸殘基的側鏈基團反應的活性基團。因此也可以和酶的活性部位發生特異性結合,並且能夠對活性部位側鏈基團進行修飾,導致酶不可逆失活。這類修飾的特點是:底物、競爭性抑制劑或配體應對修飾有保護作用;修飾反應是定量定點進行的。這種修飾作用不同於基團專一性的作用方式(圖1)。
Kcat型抑制劑專一性很高,因為這類抑制劑是根據酶催化過程設計的,它具有酶的底物性質,還有一個潛在的反應基團在酶的催化下活化後不可逆的抑制酶的活性部位。所以Kcat型抑制劑也稱為“自殺性抑制劑”。自殺性抑制劑可以用來作為治療某些疾病的有效藥物。
外生親和試劑與光親和標記
親和試劑一般可分為內生親和試劑和外生親和試劑,前者是指試劑本身的某部分通過化學方法轉化為所需要的基團,而對試劑的結構沒有大的擾動;後者是把反應性基團加入試劑中去,如將鹵代烷基衍生物連到腺嘌呤上(圖2)。
光親和試劑是一類特殊的外生親和試劑,它在結構上除了有一般親和試劑的特點外,還具有一個光反應基團。這種試劑先與酶活性部位在暗條件下發生特異性結合,被光照激活後產生一個非常活潑的功能基團能與它們附近幾乎所有基團反應,形成一個共價的標記物(圖3)。