基於碎片的藥物設計（fragmentbased drug design）是2018年公布的生物物理學名詞。
基於碎片的藥物設計（fragmentbased drug design）是2018年公布的生物物理學名詞。定義根據受體結合區域的分子表面性質，如空間性、電性、疏水性及氫鍵等，搜尋碎片庫，讓計算機自動構建出與受體結合區域性...
分子碎片藥物設計（fragment-baseddrug design）引是最近十年來剛剛興起的一種藥物研發新技術和新方法之一。分子碎片藥物設計根據Rees等人的文章介紹，最早提出這一概念並進行這方面工作的學者是Jencks和Ariens等人,他們在1990年代早期的研究工作顯示，1個有生物活性的藥物分子可看成是2個或多個小分子碎片生物活性疊加的...
因此，計算機輔助藥物設計大致包括活性位點分析法、資料庫搜尋、全新藥物設計。活性位點 1． 活性位點分析法 該方法可以用來探測與生物大分子的活性位點較好地相互作用的原子或者基團。用於分析的探針可以是一些簡單的分子或者碎片，例如水或者苯環，通過分析探針與活性位點的相互作用情況，最終可以找到這些分子或碎片在活性...
通過本項目的實施，我們已經圓滿完成目標，取得如下進展： （1）利用業內領先的藥物設計軟體MedChem Studio，對已報導的CCR5抑制劑結構按照一定規則打成碎片分子，建立了R取代基資料庫；根據化學反應原理，以1-(3-氨基丙基)-哌嗪為骨架，用R取代基資料庫對結構中的其它取代基進行替換，得到集中組合庫...
本書是一本面向套用、介紹計算機輔助藥物分子設計方法的入門書，適合從事計算機化學的研究人員及從事新醫藥、新農藥研製與開發的研究人員閱讀和參考。目錄 第一章分子結構的計算機處理 1.1分子結構信息的表達 1.1.1化合物的命名 1.1.2碎片碼、線形碼、拓撲碼 1.1.3連線表 1.2分子結構的輸入 1.3分子結構的...
2.藥物設計學：發展新的藥物設計方法和技術，如基於靶標結構的高通量虛擬篩選方法、基於基因調控網路(或通路)的高內涵虛擬篩選方法、基於靶標三維結構的集中組合庫設計方法和基於分子碎片的從頭藥物設計方法等；針對重要疾病的關鍵靶標和網路(通路)，進行藥物設計套用研究，結合化合物合成和生物學測試，發現新分子實體(...
6 計算機輔助藥物設計的方法學114 61 直接藥物設計115 611 三維結構搜尋115 6111 三維化學結構資料庫116 6112 搜尋標準117 6113 三維結構搜尋的搜尋算法118 612 全新藥物設計120 6121 模板定位法121 6122 原子生長法122 6123 分子碎片法123 6...
8左右，用於結合構象預測平均RMSD值小於1Å幾可媲美晶體結構。以上結果表明基於高精度密度泛函理論計算的蛋白藥物結合作用計算在藥物設計領域具有廣泛的套用空間和巨大的套用價值。
力爭發現具有較好活性的先導化合物。2) 計算機輔助藥物設計新方法研究 套用化學、生物學和計算科學等交叉學科的新方法和新技術，發展新的藥物設計方法和技術。如基於靶標結構的高通量虛擬篩選方法、基於天然活性成分的反向靶標虛擬篩選方法、基於靶標三維結構的集中組合庫設計和基於分子碎片的全新藥物設計方法等 ...
3.2.2基於分子三維形狀及藥效團特徵的先導方法047 3.2.3基於活性碎片的藥物分子設計047 3.3我國農藥創新品種048 3.3.1殺蟲劑的研發情況048 3.3.2殺菌劑的研發情況061 3.3.3免疫激活劑的研發情況069 3.3.4除草劑的研發情況076 參考文獻079 第4章農藥產業環保發展歷程084 4.1農藥產業環保體系建設084 4....
