《基於生物數據融合的致病microRNA識別方法研究》是依託哈爾濱工業大學，由蔣慶華擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基於生物數據融合的致病microRNA識別方法研究
- 依託單位：哈爾濱工業大學
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：蔣慶華
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
自2002年首次實驗證實microRNA與疾病密切相關以來，致病microRNA識別已成為生物醫藥領域的研究熱點。目前致病microRNA識別主要依賴生物學實驗，識別費用高、周期長。近幾年高通量生物數據呈爆炸性增長，如何發展基於海量數據融合的生物信息學方法來識別致病microRNA，意義重大。.本項目擬融合海量數據來明確編碼基因間的功能相關性，構建權重型編碼基因功能網路，識別疾病特異的網路模組，量化疾病間的表型相似度，從而發展基於數據融合的致病microRNA識別算法，開發致病microRNA識別系統。本項目的完成將為生命科學研究者有針對性地進行生物實驗提供指導，為基於microRNA的疾病診斷、治療、藥物開發提供線索。
結題摘要
在本項目的資助下，項目負責人及團隊系統研究了microRNA和人類疾病關係的生物信息學，取得了較好的科研成果，完成了既定的目標。項目負責人發現了”功能相似的microRNA失調傾嚮導致表型相似的疾病“這一規律，開發了全球首個人類疾病microRNA資料庫系統，相應的論文發表在牛津大學的著名期刊NAR上，影響因子7.459，已經被他引390次，入選“中國百篇最具國際影響力學術論文(2009)”，獲第十二屆黑龍江省自然科學技術學術成果一等獎。此外，提出了4種疾病microRNA預測方法，實驗結果顯示了方法的有效性，相應論文發表在BMC systems biology以及國際學術會議上。在完成既定目標之後，我們對microRNA的研究進行了擴展，重點研究了比microRNA長的非編碼RNA (lncRNA)。lncRNA是長度大於200bp的非編碼RNA，lncRNA的失調能導致疾病的發生髮展。我們研究了人類lncRNA基因自身如何被轉錄調控（ Jiang et al., 2014, BioMed research internatinoal），人類lncRNA有哪些生物潛在的生物學功能（Jiang et al., 2015, BMC genomics），以及lncRNA調控哪些靶基因（Jiang et al., 2015, NAR），取得了較好的研究成果。在本項目的支持下，課題組共發表已標註基金號的SCI論文10篇，開發了1個疾病micorRNA資料庫系統（http://www.mir2disease.org），4套疾病microRNA預測軟體，1個lncRNA的靶基因資料庫 （http://www.lncrna2target.org），1個lncRNA的功能注釋系統 (http://mlg.hit.edu.cn/lncrna2function)，以及1個lncRNA轉錄調控系統(http://mlg.hit.edu.cn/tf2lncrna).
