基本介紹
內容簡介,目錄,
內容簡介
本書代表了全世界200多位基因表達分析領域研究者的集體成就，全面闡述了幾乎每一種分析基因表達的技術和方法，不僅包括轉錄、轉錄後、翻譯和翻譯後水平基因表達的基本背景知識，還包括每種方法的實驗程式以及均衡的、無偏的處理，並儘可能多地囊括了當前可以利用的網路資源，真可謂現代生物學中這一領域的百科全書。
本書內容包括基因表達的基礎理論、樣品製備方法、mRNA的高通量表達方法、蛋白質的表達分析、mRNA和蛋白質的原位及體內分析等，並對生物信息工具和計算機分析方法做了重點介紹。
可供從事基因表達分析工作的科研人員和技術人員參考使用，並可作為高等院校相關專業教師和研究生的教學參考用書。
本書內容包括基因表達的基礎理論、樣品製備方法、mRNA的高通量表達方法、蛋白質的表達分析、mRNA和蛋白質的原位及體內分析等，並對生物信息工具和計算機分析方法做了重點介紹。
可供從事基因表達分析工作的科研人員和技術人員參考使用，並可作為高等院校相關專業教師和研究生的教學參考用書。
目錄
上卷
第1章 基因表達的基本概念
1.1 引言
1.2 細胞內的轉錄與翻譯
1.2.1 概述
1.2.2 轉錄
1.2.3 翻譯
1.2.4 小結
1.3 轉錄調控
1.3.1 概述
1.3.2 mRNA表達譜——轉錄組（transcriptome）
1.3.3 蛋白質表達譜——蛋白質組（proteome）
1.3.4 基因和蛋白質的相互作用——互作組（interactome）
1.3.5 轉錄裝置與核心啟動子
1.3.6 調節啟動子
1.3.7 增強子
1.3.8 基因座控制區
1.3.9 基質附著區
1.3.10 隔絕子
1.3.11 RIDGE曾強的基因表達區
1.3.12 增強子體
1.3.13 染色質
1.3.14 沉默子元件
1.3.15 轉錄因子、阻遏因子和輔助阻遏因子
1.3.16 表觀遺傳學
1.3.17 概括和總結
1.4 轉錄後調控
1.4.1 概述
1.4.2 RNA穩定性和降解的調控
1.4.3 轉錄延伸的調控
1.4.4 前體mRNA的差別/可變剪接
1.4.5 反式RNA剪接
1.4.6 mRNA轉運的調控
1.4.7 定向的細胞 mRNA定位
1.4.8 mRNA聚腺苷酸化的調控
1.4.9 反式RNA
1.4.10 RNA編輯
1.4.11 小結
1.5 蛋白質的翻譯後修飾
1.5.1 概述
1.5.2 蛋白質的酶促剪下
1.5.3 乙醯化
1.5.4 （聚）異戊二烯基化
1.5.5 甲基化
1.5.6 硫酸化
1.5.7 磷酸化
1.5.8 泛素化
1.5.9 糖基化
1.5.10 小結
1.6 mRNA與蛋白質表達的相關性
1.6.1 概述
1.6.2 mRNA水平和蛋白質的表達：相關性和差異性
1.6.3 小結
1.7 持家基因及內部和外部的標準
1.7.1 什麼是持家基因
1.7.2 重要持家基因概述
1.7.3 其他常用的持家基因
1.7.4 新確定的維持基因
1.7.5 定量方法
1.7.6 小結
1.8 不同基因表達技術的分類
1.8.1 概述
1.8.2 從單個基因到轉錄組
1.8.3 分類的方法
1.8.4 小結
1.9 總結
1.10 參考文獻
第2章 樣品製備與輔助工具
2.1 引言
2.2 細胞和組織的製備
2.2.1 免疫法純化細胞
2.2.2 差速離心/反向洗脫
2.2.3 表面親和層析
2.2.4 密度梯度離心
2.2.5 流式細胞術
2.2.6 組織微分離技術
2.2.7 各種細胞的分離和培養技術
2.3 核酸和蛋白質的製備
2.3.1 概述
2.3.2 總RNA和mRNA的分離
2.3.3 分離前RNA的穩定性
2.3.4 從培養的細胞和組織中製備蛋白質樣品
2.4 總結
2.5 參考文獻
第3章 mRNA表達的分析方法
下卷
第4章 mRNA表達的高通量分析方法
第5章 蛋白質表達分析
第6章 原位和體內的mRNA及蛋白質表達分析方法
第7章 計算方法和生物信息學工具
索引
第1章 基因表達的基本概念
1.1 引言
1.2 細胞內的轉錄與翻譯
1.2.1 概述
1.2.2 轉錄
1.2.3 翻譯
1.2.4 小結
1.3 轉錄調控
1.3.1 概述
1.3.2 mRNA表達譜——轉錄組（transcriptome）
1.3.3 蛋白質表達譜——蛋白質組（proteome）
1.3.4 基因和蛋白質的相互作用——互作組（interactome）
1.3.5 轉錄裝置與核心啟動子
1.3.6 調節啟動子
1.3.7 增強子
1.3.8 基因座控制區
1.3.9 基質附著區
1.3.10 隔絕子
1.3.11 RIDGE曾強的基因表達區
1.3.12 增強子體
1.3.13 染色質
1.3.14 沉默子元件
1.3.15 轉錄因子、阻遏因子和輔助阻遏因子
1.3.16 表觀遺傳學
1.3.17 概括和總結
1.4 轉錄後調控
1.4.1 概述
1.4.2 RNA穩定性和降解的調控
1.4.3 轉錄延伸的調控
1.4.4 前體mRNA的差別/可變剪接
1.4.5 反式RNA剪接
1.4.6 mRNA轉運的調控
1.4.7 定向的細胞 mRNA定位
1.4.8 mRNA聚腺苷酸化的調控
1.4.9 反式RNA
1.4.10 RNA編輯
1.4.11 小結
1.5 蛋白質的翻譯後修飾
1.5.1 概述
1.5.2 蛋白質的酶促剪下
1.5.3 乙醯化
1.5.4 （聚）異戊二烯基化
1.5.5 甲基化
1.5.6 硫酸化
1.5.7 磷酸化
1.5.8 泛素化
1.5.9 糖基化
1.5.10 小結
1.6 mRNA與蛋白質表達的相關性
1.6.1 概述
1.6.2 mRNA水平和蛋白質的表達：相關性和差異性
1.6.3 小結
1.7 持家基因及內部和外部的標準
1.7.1 什麼是持家基因
1.7.2 重要持家基因概述
1.7.3 其他常用的持家基因
1.7.4 新確定的維持基因
1.7.5 定量方法
1.7.6 小結
1.8 不同基因表達技術的分類
1.8.1 概述
1.8.2 從單個基因到轉錄組
1.8.3 分類的方法
1.8.4 小結
1.9 總結
1.10 參考文獻
第2章 樣品製備與輔助工具
2.1 引言
2.2 細胞和組織的製備
2.2.1 免疫法純化細胞
2.2.2 差速離心/反向洗脫
2.2.3 表面親和層析
2.2.4 密度梯度離心
2.2.5 流式細胞術
2.2.6 組織微分離技術
2.2.7 各種細胞的分離和培養技術
2.3 核酸和蛋白質的製備
2.3.1 概述
2.3.2 總RNA和mRNA的分離
2.3.3 分離前RNA的穩定性
2.3.4 從培養的細胞和組織中製備蛋白質樣品
2.4 總結
2.5 參考文獻
第3章 mRNA表達的分析方法
下卷
第4章 mRNA表達的高通量分析方法
第5章 蛋白質表達分析
第6章 原位和體內的mRNA及蛋白質表達分析方法
第7章 計算方法和生物信息學工具
索引
