蛋白質或肽的氨基末端分析法之一。由埃德曼（ P． Edman）所創立。即在弱鹼性條件下使之與異硫氰酸苯酯反應，然後用酸處理，從多肽鏈上僅使氨基末端殘基以胺基酸的苯基乙內醯硫脲衍生物的形態游離出來，然後進行分析。根據反應試劑或衍生物的縮寫，本法亦稱 PTC法或 PTH法。
基本介紹
- 中文名：埃德曼降解反應
- 外文名：Edmandegradation
- 創立者：埃德曼
Edman降解(Edmandegradation)
從多肽鏈游離的N末端測定胺基酸殘基的序列的過程。N末端胺基酸殘基被異硫氰酸苯酯修飾，然後從多肽鏈上切下修飾的殘基，再經層析鑑定，餘下的多肽鏈（少了一個殘基）被回收再進行下一輪降解循環。
用異硫氰酸苯酯（PITC）與待分析多肽的N-端氨基在鹼性條件下反應，生成苯氨基硫代甲醯胺（PTC）的衍生物，然後用酸處理，關環，肽鏈N-端被選擇性地切斷，得到N-端胺基酸殘基的噻唑啉酮苯胺衍生物。接著用有機溶劑將該衍生物萃取出來，酸作用下，該衍生物不穩定，會繼續反應，形成一個穩定的苯基乙內醯硫脲（PTH）衍生物。餘下肽鏈中的醯胺鍵不受影響。通過用HPLC或電泳法分析生成的苯乙內醯硫脲（PTH-胺基酸），可以鑑定出是哪一個胺基酸。每反應一次，結果是得到一個去掉N-端胺基酸殘基的多肽，剩下的肽鏈可以進入下一個循環，繼續發生降解。
以上方法已經可以自動化。用根據此原理設計出的自動分析儀進行分析時，能夠可靠地測定肽鏈的30個左右胺基酸殘基序列，最多可以分析50-60個胺基酸殘基。在最好的條件下，每形成一次PTH-胺基酸，效率可保持在99%以上。而且此法用量少，一般只用10-100皮摩爾的多肽即可測定胺基酸序列。對於肽鏈較長的多肽，可以先將肽鏈切斷成多個小肽，對這些小肽進行胺基酸分析，然後將這些信息拼接起來，得到起始肽鏈中的胺基酸序列。
限制：
由於Edman降解是以化學試劑對N-端氨基的修飾為基礎的，因此當N-端被其他化學基團所封閉時，就需要先去除這些基團，然後才能進行測序。此外，蛋白質中含有半胱氨酸殘基時，有時兩個半胱氨酸殘基會發生二硫鍵交聯。這種情況下，需要先用過酸將二硫鍵氧化為–SO3H，然後才能用Edman降解測定序列。
