啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
基本介紹
- 中文名:啟動子分析
- 外文名:promoter analysis
- 所屬學科:計算機科學技術
- 公布時間:2018年
啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。定義分析與確定DNA序列中位於基因上游的調控區域,即啟動子。它是一個用於調控基因轉錄的控制位點。出處《計算機科學技術名詞 》第三版。1...
啟動子是RNA 聚合酶識別、結合和開始轉錄的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特異性結合和轉錄起始所需的保守序列,多數位於結構基因轉錄起始點的上游,啟動子本身不被轉錄。但有一些啟動子(如tRNA啟動子)位於轉錄起始點的下游,這些DNA序列可以被轉錄。啟動子的特性最初是通過能增加或降低基因轉錄速率的突變而鑑定的。...
④序列分析序列同源性分析採用DNAman軟體完成,啟動子序列調控元件分析利用植物順勢調控元件資料庫PLACE和PlantCaret完成。結果與分析 目的片段的擴增結果 以馬鈴薯總DNA為模板擴增所得產物經l%瓊脂糖凝膠電泳檢測,得到大小約為600 bp的DNA片段(圖1略),條帶單一、整齊、明亮。重組質粒的PCR檢測及酶切鑑定 以初步篩選...
以噻菌靈誘導並分析GFP基因表達活性,以闡明該啟動子在單子葉和雙子葉植物的的適用性、各種組織器官的表達活性等功能特點。進一步利用該啟動子構建多個水稻基因RNA干涉載體,對水稻生殖發育相關基因進行可調控基因沉默研究,以此驗證該啟動子在植物基因的克隆和功能研究方面的套用價值。
該啟動子 -222~-173bp負責驅動基因在植物綠色組織和根尖中表達,其中-219/-203是TGACG重複基序,即as1 (activating sequence 1),-183/-180為 GATA(又稱為as2),這兩個元件的互作對控制基因在綠色組織中表達至關重要。該啟動子-178~-63bp包含負責調控基因在維管組織中表達的 元件。CsVMV啟動子在轉基因葡萄...
轉基因菸草或擬南芥,通過報告基因活性變化分析該啟動子的核心元件;替換pCAMBIA1300-221載體上的CaMV35S啟動子,比較兩種啟動子對報告基因活性的影響;同時探索光強、AsA等對轉基因菸草或擬南芥報告基因表達的影響,以及轉基因菸草或擬南芥光合、葉綠素螢光特性和葉黃素循環組分的變化,深入研究該啟動子的調控原理,為姜光...
《環境脅迫應答基因ATMPK3的啟動子分析及轉錄因子克隆》是依託清華大學,由劉強擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 克隆了乾旱、高鹽、低溫及愈傷脅迫應答的ATMPK3啟動子並確定了其序列。利用轉基因菸草植株進行分析,已確定與乾旱、高鹽及低溫脅迫應答有關的順式元件的啟動子區域。利用上述啟動子區域片斷構建酵母報導...
CMV啟動子,是大家公認的啟動真核基因表達的最有力量的啟動子。CMV基因組有229kb,屬皰疹病毒亞β科。CMV DNA只有一個單向性的IE啟動子複合體,可指導多個基因的表達。在IE94基因上游存在一個強啟動子,IE94的上游區比SV40病毒72bp重複序列具有更高的增強子功能IE94基因啟動子區序列分析證明這一區段內有多個回文...
《番茄DR8基因功能鑑定及其啟動子調控分析》是依託重慶大學,由李正國擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 生長素和乙烯對果實的生長發育和成熟過程起著重要的調控作用。番茄果實成熟相關新基因- - DR8,與擬南芥的生長素反應基因家族(Aux/IAA)具有很高的同源性。經表達分析表明:DR8在果實發育過程中穩定表達,但在...
CaMV35S啟動子是指來自花椰菜花葉病毒( CaMV )的35S啟動子。這種啟動子在植株被CaMV感染期間,指導35S RNA合成,並且使之在許多雙子葉植物的組織中高效表達,但它是單子葉植物的一種較弱的啟動子。CaMV35S啟動子作為一種組成型啟動子在所有組織中都能啟動基因的表達,具有持續性,不表現時空特異性;RNA和蛋白質...
《番茄miR167多基因座的表達特徵及其啟動子調控分析》是依託重慶大學,由李正國擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 番茄miR167對植物的生長素信號轉導具有重要調節作用。我們研究發現miR167在基因組中存在3個基因座,受控於不同的啟動子,能產生3個不同的miR167前體,表明這3個基因座可能存在明顯的表達時空特異性,...
基因表達分析技術 基因表達分析技術是分析技術。1、轉錄起始位點確定 2、轉錄水平分析 3、轉錄控制元件(啟動子、順式作用原件)4、基因表達產物的組織器官和亞細胞定位
啟動子是基因表達調控的必要元件。植物啟動子在全基因組水平的鑑定及其結構與功能分析,不僅對闡述與基因表達調控相關的基本理論問題具有重要的參考價值,而且為植物基因工程中啟動子的選擇與人工改造提供理論依據。本項目首先運用DNase-seq同時結合mRNA-seq, 在全基因組水平上鑑定水稻幼苗、幼根、幼穗及愈傷等四種組織的...
《棉鈴蟲膽固醇載體蛋白-2基因啟動子的克隆與功能分析》是依託華中師範大學,由彭蓉擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 棉鈴蟲是抗藥性很強的世界性農業主要害蟲,研發對這類害蟲有獨特作用機理的殺蟲劑備受關注。膽固醇載體蛋白-2(SCP-2)基於其運輸膽固醇的重要作用,被證明是一種能通過影響蟲體膽固醇代謝來...
《胡楊肉質化關鍵基因PeXTH的啟動子分析與轉錄調控研究》是依託山西大學,由韓彥莎擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 鹽脅迫下組織發生肉質化是胡楊適應長期鹽漬環境的重要方式。前期研究表明胡楊PeXTH基因在葉片肉質化過程中發揮重要作用,該基因受到鹽脅迫誘導轉錄,但其轉錄調控的分子機制並不明確。我們前期...
為了改良水稻根系生長,提高水稻根系對磷的吸收和利用效率,避免使用組成型啟動子帶來的不利影響。本研究對水稻根特異表達基因Os03g01700啟動子的特異元件進行了分析,同時,利用水稻根特異表達基因Os03g01700的啟動子調控OsMYB2P-1在水稻根中特異表達。 項目對水稻根特異表達基因Os03g01700的啟動子啟動子-2013bp~-...
測序並根據其序列設計特異引物,利用不平衡PCR和反向PCR技術從基因組DNA中獲得花組織特異性啟動子;通過缺失突變確定啟動子的有效功能區,替換pBI121中的35S啟動子構建表達載體;通過農桿菌介導轉化菸草等,獲得轉基因菸草植株;進行PCR、Southern檢測,並進行GUS基因表達特性分析,對毛白楊雌雄花組織特異性啟動子特性進行...
根據特異蛋白種類與胺基酸序列的分析,採用RT-PCR、TAIL-PCR等技術克隆其編碼基因及啟動子,分析並獲得具有完整結構的啟動子序列;構建含特異性啟動子的融合基因及植物表達載體,採用基因槍轉化法轉化離體桑雌花穗,檢測報告基因在雌花器官中的瞬時表達活性;可望獲得在桑雌蕊中高豐度表達的特徵蛋白5-10個、相關基因5個...
增殖細胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)是一種在DNA複製、DNA修復、細胞周期調控等機制中發揮重要功能的核蛋白,我們對人增殖細胞核抗原(human proliferating cell nuclear antigen,hPCNA)基因—538~+60區域啟動子的調控做了比較全面的分析,著重研究了5′啟動子中的血清刺激應答元件以及PCNA在細胞周期DNA...
組織特異型啟動子能驅動外源基因在特定組織器官中高效表達,對作物品質改良,提高抗性和產量等方面具有重要作用。項目前期分析了甘藍型油菜和擬南芥基因表達譜,篩選了油菜根、莖稈、葉片和角果皮特異表達基因各1個,獲得了基因的啟動子序列。後續研究將利用RT-PCR檢測基因在油菜中的組織特異性;5′RACE定位基因的轉錄起始...
啟動子區啟動基因表達,其異常涉及腫瘤的發生髮展,Sp1在胃癌中的高表達與其啟動子遺傳變異是否相關目前未見報導。本研究基於既往的臨床病理資料庫和組織晶片庫基礎上,通過DNA測序,篩選出3個Sp1啟動子區突變位點(C-684T, T-617G和T-637C),分析表明它們在胃癌中的發生率分別為3.96 %、1.98%以及5.94%。分別...
擬解決的關鍵科學問題包括(1)分析和提取組織特定性啟動子的生物特徵。(2)啟動子的結構表示和不確定參數的估計問題。(3)多模態生物特徵動態融合中權重賦值的問題。結題摘要 (1)本項目主要研究如何利用機率圖模型等機器學習技術來解決計算生物領域的若干問題,例如基因演化分析等問題;(2)本項目主要成果:(a)提出...
啟動子捕獲是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。 定義 用於確定基因組DNA啟動子區域的一項技術。用做檢測的載體含有報導基因可作表達的標記,但缺乏啟動子,將擬檢測的DNA序列克隆入這種載體的適當位置,導入細胞或個體,從報導基因表達的程度可分析出啟動子的存在與否及其強弱。出處 《生物化學與分子生物學名詞》...
1.1 植物啟動子研究進展 1.2 楊樹TIR-NBS類抗病相關基因及其啟動子研究概況 1.3 立題依據與技術路線 2 毛白楊PtDrl02基因的表達特性及其啟動子區的克隆與分析 2.1 材料與方法 2.2 結果與分析 2.3 討論 3 毛白楊PtDr102啟動子的結構分析與功能鑑定 3.1 材料與方法 3.2 結果與分析 ...
檢測部件有兩部分組成,即一個已失去啟動子且易於檢測的遺傳標記基因以及克隆位點。用作檢測遺傳標記基因主要有抗生素抗性基因和綠色螢光蛋白基因等。誘導型表達 誘導型表達載體指啟動子必須在特殊的誘導條件下才有轉錄活性或比較高的轉錄活性的表達載體。外源基因處於這樣的啟動子下,必須在合適的誘導條件下才能表達。採用...
順式作用元件是同一DNA分子中具有特殊功能的轉錄因子DNA結合位點和其它調控基序,在基因轉錄起始調控中起重要作用;按功能特性分為通用調節元件如啟動子、增強子及沉默子和專一性元件如激素反應元件,cAMP反應元件;確定順式作用元件的試驗方法主要有:DNA結構分析、序列分析和基因刪除或替換等,軟體預測是確定順式作用元件...
染色體上相鄰基因之間有區分標誌,DNA上啟動子和終止子及之間的核苷酸序列為一個基因。啟動子和終止子都是特定的核苷酸序列。基本信息 標記染色體分析 (Markerchromosomeanalysis)檢測代號︰P95 致病機轉︰多屬自然發生(denovo),少數為遺傳而來。臨床症狀︰依據染色體的來源,會有不一的臨床症狀,需進行充分的遺傳諮詢。...
植物瞬時表達系統在啟動子分析、基因功能分析和生產重組蛋白方面用途廣泛。並且具有如下優點:①簡單快速。轉化基因可在轉化的一周內進行分析,避免了組織培養等繁雜過程;②表達水平高。當單鏈的T-DNA進入植物細胞後,許多未整合到植物基因組中的游離外源基因同樣可以表達。③安全有效。不受植物生長發育過程的影響,不...
內容包括在基因和蛋白水平定位DLX3在牙胚發育不同階段的表達;採用過表達,基因沉默和啟動子分析等方法確定DLX3下游的釉質發育不全相關的目的基因及其之間的調控方式;明確DLX3基因在釉質發育中的上游信號通路;驗證同源盒家族分子間的蛋白-蛋白間的相互作用。研究結果有利於為進一步揭示人類釉質發育不全的致病機理提供...