2017年11月13日,周斌研究組在國際學術期刊《自然·醫學(Nature Medicine)》 發表科研成果“Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases ”。該研究將Dre-rox同源重組系統引入到傳統的基於Cre-loxP同源重組系統的遺傳譜系示蹤技術中,有效地規避了由於Cre表達的不特異性而導致的非特異性(“異位”)同源重組,實現了更為精準的遺傳譜系示蹤,為發育、幹細胞及再生等領域的深入研究奠定了可靠的技術基礎。
2018年5月10日,周斌研究組在國際學術期刊《自然評論心臟病學(Nature Reviews Cardiology)》發表題為“Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in cardiovascular diseases”的綜述文章。該文章系統闡述了在心臟發育和疾病過程中內皮細胞向間充質細胞轉換的作用。
2018年6月5日,周斌研究組在國際學術期刊《細胞研究(Cell Research)》發表研究進展“Embryonic senescent cells re-enter cell cycle and contribute to tissues after birth”。此研究揭示了小鼠胚胎髮育過程中衰老細胞(senescent cell)的命運,衰老細胞不會被全部清除,其中一部分可以保留到出生後,並且部分細胞會重新進入細胞周期,進行增殖。
2021年2月26日,周斌研究組在國際學術期刊《Science》發表研究成果“Proliferation tracing reveals regional hepatocyte generation in liver homeostasis and repair”。該研究首次開發了能夠長時程示蹤體內細胞增殖的新技術。
2021年3月16日,周斌研究組在國際學術期刊《自然代謝(Nature Metabolism)》發表研究成果“Pre-existing beta cells but not progenitors contribute to new beta cells in the adult pancreas”。該研究開發了能夠同時示蹤胰島beta細胞和非beta細胞的雙同源重組介導的譜系示蹤新技術,利用該技術研究人員揭示了成體胰島beta細胞的來源,發現在正常穩態及組織損傷情況下成體胰島beta細胞來源於自我增殖,而非幹細胞分化。
2021年11月2日,周斌受邀在國際學術期刊《細胞代謝(Cell Metabolism)》發表了題為“Pancreatic beta cell neogenesis: Debates and updates”文章,對發表於《細胞幹細胞(Cell Stem Cell)》上的題為“Ductal Ngn3-expressing progenitors contribute to adult beta cell neogenesis in the pancreas”的研究工作進行了導讀、評論和展望。
2022年12月2日,周斌研究組在國際學術期刊《Science》發表研究成果“Monitoring of cell-cell communication and contact history in mammals”。該研究基於合成生物學結合體內遺傳學技術,開發了可以捕捉體內細胞間相互作用並能夠永久追蹤鄰近細胞的創新研究工具——鄰近細胞遺傳學技術。利用該技術,研究人員揭示了心臟內皮細胞在早期胚胎髮育過程中遷移到肝臟並轉變成為肝血竇內皮細胞,以及在腫瘤生長過程中腫瘤血管內皮細胞遷移到腫瘤外包膜的現象。
2023年1月3日,周斌研究組在國際學術期刊《美國國家科學院院刊》發表研究成果“Genetic dissection of intercellular interactions in vivo by membrane-permeable protein”。該研究利用表達膜透過性螢光蛋白的遺傳工具小鼠,建立了體內鄰近細胞標記技術,並利用該技術揭示了肝臟不同區域中內皮細胞的異質性。
2023年3月13日,周斌研究組在國際學術期刊《自然遺傳學(Nature Genetics)》發表研究論文“Bipotent transitional liver progenitor cells contribute to liver regeneration”。研究人員在人類多種肝臟疾病和小鼠肝損傷模型中鑑定出一群同時表達膽管上皮細胞和肝細胞特徵的肝臟祖細胞;發現這群肝臟祖細胞起源於膽管上皮細胞;利用雙同源重組示蹤技術發現這群肝臟祖細胞具有向膽管上皮細胞和肝細胞分化的能力;通過基因敲除及過表達發現Notch和WNT/β-catenin信號通路分別調控膽管上皮細胞向肝臟祖細胞、肝臟祖細胞向肝細胞的分化。
2023年6月2日,周斌研究組在國際學術期刊《自然協定(Nature Protocols)》發表研究成果“Genetic recording of in vivo cell proliferation by ProTracer”。該研究系統闡述了細胞增殖示蹤技術——ProTracer的構建及套用,並以肝細胞增殖的示蹤為例,詳細地介紹了如何利用ProTracer技術示蹤成體哺乳動物在器官穩態與修復再生過程中的細胞增殖。
2023年6月12日,周斌研究組在國際學術期刊《美國國家科學院院刊(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)》發表研究成果“An inducible hACE2 transgenic mouse model recapitulates SARS-CoV-2 infection and pathogenesis in vivo”。該研究利用Cre-loxP遺傳譜系示蹤技術與人源化hACE2結合,創建了一種誘導型hACE2小鼠模型,結合細胞特異性Cre工具小鼠可實現在靶細胞中特異性表達hACE2蛋白並同時對靶細胞進行遺傳示蹤。
2023年8月3日,周斌研究組在國際學術期刊《npj Regenerative Medicine》發表研究成果“Functional ProTracer identifies patterns of cell proliferation in tissues and underlying regulatory mechanisms”。該研究在先前增殖追蹤系統ProTracer的基礎上進行改進最佳化,構建了一種可以在體內組織中特異性追蹤細胞增殖,同時利用基因敲除工具鼠揭示具體細胞類型增殖調控機制的新系統。
2024年2月15日,周斌研究組在國際學術期刊《循環研究(Circulation Research)》發表綜述文章“Application of New Lineage Tracing Techniques in Cardiovascular Development and Physiology”,該論文回顧了遺傳譜系示蹤技術在心臟發育與再生研究中的套用,詳細介紹了雙同源重組系統以及鄰近細胞系統在心臟多種細胞類型研究中的發展與套用,主要圍繞心肌細胞、冠狀血管以及間充質細胞群展開介紹。
2024年4月4日,周斌研究組的成果“Tracing the origin of alveolar stem cells in lung repair and regeneration”在國際學術期刊《Cell》上發表。該研究建立了追蹤肺上皮細胞的Cre-loxP和Dre-rox雙同源重組酶介導的遺傳譜系示蹤新技術,結合多種小鼠肺臟損傷模型,系統研究了肺泡上皮幹細胞的再生起源並揭示其細胞命運調控的分子機制。