同族鼠是指二個以上系統之間有一部分基因不同而其它基因都相同的純系鼠，例如C57BL/10（H－2b）系與DBA/2（H－2d）係為不同的系統，但C57BL/10鼠的H－2基因用DBA/2的同基因置換了的B10．D2鼠，有H－2d，但其它基因與C57BL/10是相同的，稱B10．D2與C57BL/10為同族。
同族鼠是指二個以上系統之間有一部分基因不同而其它基因都相同的純系鼠，例如C57BL/10（H－2b）系與DBA/2（H－2d）係為不同的系統，但C57BL/10鼠的H－2基因用DBA/2的同基因置換了的B10．D2鼠，有H－2d，但其它基因與C57BL/10是相同的，稱B10．D2與C57BL/10為同族。這種僅H－2基因不同的情況稱同族抵抗鼠（congenic resistant mou-se）。同族關係並不限與H－2基因有關，例如，C3H系與AKR系二者都為H－2k，但其它基因則不同，例如T細胞特異抗原的Thy 1抗原，在C3H為Thy 1．2，而AKR為Thy 1．1，然而只將AKR的Thy 1．1用C3H的Thy 1．2置換成的AKR-Thy 1．2與原來的AKR系對Thy 1抗原之外的基因來說是同族系。關於形成同族鼠，以Thy 1抗原為例，用C3H與AKR交配，以後以Thy 1．2抗原之有無為指標，與AKR回交（10世代以上），這樣在Thy 1抗原以外之基因，便都成了AKR系。同族鼠只是特定的基因產物不同，所以一方的細胞或體液成分可使另一方免疫，可以產生對特定抗原的抗體或免疫反應細胞。這對現代免疫學是很大的貢獻。
